More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1612 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 496 aa  1016    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  100 
 
 		 496 aa  1016    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  99.8 
 
 		 496 aa  1014    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  63.31 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  61.62 
 
 		 506 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  61.04 
 
 		 511 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  60.89 
 
 		 506 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  60.92 
 
 		 506 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  61.09 
 
 		 497 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  60.69 
 
 		 506 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  60.61 
 
 		 528 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  60.48 
 
 		 506 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  60.48 
 
 		 506 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  60.48 
 
 		 506 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2434  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.44 
 
 		 540 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2159  ABC transporter related  57.32 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.634503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1197  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 		 506 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2070  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 		 859 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0501003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1641  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.8 
 
 		 534 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0578251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0303  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.8 
 
 		 535 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0120484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1921  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 		 535 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0857  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.8 
 
 		 535 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1908  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  59.6 
 
 		 535 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00738158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  48.79 
 
 		 499 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  48.79 
 
 		 499 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  46.95 
 
 		 514 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  46.36 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  48.18 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  45.88 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  45.88 
 
 		 497 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  45.77 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.58 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  46.54 
 
 		 500 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.88 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  45.67 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.94 
 
 		 495 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  45.67 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  45.45 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.56 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.64 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.69 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  47.11 
 
 		 508 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  45.36 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  46.34 
 
 		 515 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  42.97 
 
 		 492 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.51 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  43.52 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.95 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.14 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.15 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  44.84 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  45.66 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.96 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  44.42 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  44.51 
 
 		 524 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  44.84 
 
 		 524 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  44.51 
 
 		 524 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.87 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.35 
 
 		 514 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.35 
 
 		 514 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  44.73 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.76 
 
 		 507 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.83 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.4 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.35 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.35 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.87 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  44.35 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  46.75 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  44.35 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  44.35 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  44.35 
 
 		 501 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  44.78 
 
 		 505 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  44.96 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  45.12 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 		 515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  44.81 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.94 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  44.15 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.89 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.74 
 
 		 519 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.86 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  43.85 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  44.15 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  44.04 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.65 
 
 		 513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  43.03 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  42.8 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.76 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>