71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1487 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  44.16 
 
 		 1446 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  40.22 
 
 		 1421 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  46.99 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  38.64 
 
 		 540 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  49.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  49.41 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  49.41 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  49.41 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  37.65 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  47.37 
 
 		 1379 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  37.65 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  37.21 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  45 
 
 		 1229 aa  57  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  43.21 
 
 		 1419 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1409 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  47.3 
 
 		 386 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  45 
 
 		 855 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  41.56 
 
 		 1385 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  41.56 
 
 		 1400 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  39.19 
 
 		 1359 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1410 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35.9 
 
 		 1423 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  37 
 
 		 592 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 406 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  35.9 
 
 		 1475 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  35.9 
 
 		 1457 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  57.89 
 
 		 1505 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  57.89 
 
 		 1600 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  57.89 
 
 		 1616 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  41.43 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  30.99 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  42.5 
 
 		 1140 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  37.04 
 
 		 439 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  35.8 
 
 		 434 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 444 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  31.76 
 
 		 1422 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  39.24 
 
 		 1411 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  38.71 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  38.71 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  35.87 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  32.94 
 
 		 1447 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  33.78 
 
 		 1437 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  36 
 
 		 1402 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  35.9 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  36 
 
 		 1390 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  36 
 
 		 1418 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  37.97 
 
 		 1604 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  36 
 
 		 456 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  30.26 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  35 
 
 		 456 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  37.97 
 
 		 1583 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  38.95 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  37.04 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  29.49 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  41.43 
 
 		 1386 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 461 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  44.59 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  34.78 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  34.25 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>