49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1451 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  99.54 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  70.51 
 
 		 219 aa  315  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  70.05 
 
 		 219 aa  315  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  66.67 
 
 		 219 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  66.67 
 
 		 219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  61.54 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  61.54 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  61.09 
 
 		 224 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  59.63 
 
 		 224 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  61.93 
 
 		 223 aa  260  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  59.63 
 
 		 221 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  62.96 
 
 		 220 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  58.96 
 
 		 221 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  58.05 
 
 		 224 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  61.86 
 
 		 221 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  64.1 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  64.1 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  55.5 
 
 		 219 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  64.1 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  64.1 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  64.1 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  57.56 
 
 		 224 aa  251  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  61.57 
 
 		 219 aa  251  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  64.1 
 
 		 224 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  61.42 
 
 		 225 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  64.1 
 
 		 224 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  61.58 
 
 		 224 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  58.45 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  61.54 
 
 		 169 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  47.69 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  47.96 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  44.29 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  36.68 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  36.68 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  36.68 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  33.02 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  35.39 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  33.14 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  31.89 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  31.95 
 
 		 245 aa  88.6  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  30.82 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  27.63 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1196  hypothetical protein  23.12 
 
 		 449 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00854603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  28.8 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  26.75 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2498  putative lipoprotein  23.68 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>