More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1417 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 393 aa  821    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  99.49 
 
 		 393 aa  816    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  99.75 
 
 		 393 aa  819    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  49.22 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  46.91 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  47.07 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  46.86 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  47.59 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  46.15 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  45.61 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  45.04 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  44.22 
 
 		 386 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  44.62 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  44.42 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  42.12 
 
 		 386 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  46.08 
 
 		 393 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  42.49 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  41.15 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  41.79 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  41.15 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  41.15 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  41.15 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  40.89 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  40.89 
 
 		 383 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  48.45 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  40.89 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  41.01 
 
 		 409 aa  342  8e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  40.62 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  40.62 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  43.38 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  40.36 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  44.82 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  40.66 
 
 		 392 aa  330  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  41.6 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  41.73 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  41.9 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 		 372 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  41.58 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  41.58 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  39.44 
 
 		 393 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  40.92 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  41.6 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  38.36 
 
 		 388 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  36.39 
 
 		 390 aa  298  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  38.17 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  37.91 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  38.15 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  38.11 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  37.85 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  37.06 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  37.02 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  37.79 
 
 		 404 aa  285  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  36.43 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  37.88 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  36.01 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  37.15 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  37.03 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  34.26 
 
 		 405 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  35.96 
 
 		 385 aa  282  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  36.96 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  37.37 
 
 		 383 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  37.18 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  37.14 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  37.14 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  37.14 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  37.14 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  36.95 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  38.81 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  38.81 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  38.81 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  34.96 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  35.05 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  35.94 
 
 		 384 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  34.86 
 
 		 387 aa  268  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  36.97 
 
 		 400 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  36.95 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  36.95 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  35.81 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  35.66 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  37.84 
 
 		 402 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  35.7 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  34.38 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  33.85 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  33.85 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  33.85 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  33.85 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  33.59 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>