More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1391 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  84.13 
 
 		 759 aa  1329    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  84.26 
 
 		 759 aa  1331    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  52.86 
 
 		 752 aa  762    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  51.4 
 
 		 749 aa  718    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  45.72 
 
 		 759 aa  648    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  61.52 
 
 		 769 aa  914    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  55.44 
 
 		 759 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  63.54 
 
 		 773 aa  971    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  63.13 
 
 		 781 aa  951    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  60.19 
 
 		 776 aa  885    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  61.66 
 
 		 769 aa  937    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  61.79 
 
 		 771 aa  940    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  64.98 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  63.32 
 
 		 766 aa  928    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  58.03 
 
 		 774 aa  861    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  59.79 
 
 		 774 aa  871    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  58.17 
 
 		 774 aa  862    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  62.02 
 
 		 773 aa  942    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  63.05 
 
 		 765 aa  927    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  59.47 
 
 		 770 aa  887    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  61.01 
 
 		 768 aa  899    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  61.66 
 
 		 769 aa  937    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  64.98 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  64.98 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  62.3 
 
 		 764 aa  916    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  85.58 
 
 		 759 aa  1347    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  59.47 
 
 		 779 aa  914    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  63.49 
 
 		 759 aa  944    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  63.01 
 
 		 758 aa  965    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  62.87 
 
 		 777 aa  974    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  62.85 
 
 		 774 aa  929    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  47.52 
 
 		 763 aa  662    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  56.95 
 
 		 757 aa  856    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  56.78 
 
 		 760 aa  824    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  64.98 
 
 		 773 aa  996    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  61.79 
 
 		 769 aa  940    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  57.16 
 
 		 777 aa  837    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  53.23 
 
 		 755 aa  771    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  48.42 
 
 		 763 aa  667    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  45.56 
 
 		 759 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  55.57 
 
 		 759 aa  832    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  64.31 
 
 		 756 aa  981    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  62.93 
 
 		 785 aa  951    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  59.58 
 
 		 782 aa  905    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  51.47 
 
 		 752 aa  750    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  64.98 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  60.93 
 
 		 770 aa  900    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  61.66 
 
 		 769 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  55.35 
 
 		 759 aa  845    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  49.34 
 
 		 753 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  62.33 
 
 		 768 aa  945    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  64.45 
 
 		 756 aa  987    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  48.01 
 
 		 771 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  56.18 
 
 		 769 aa  782    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3291  malic enzyme  49.93 
 
 		 754 aa  658    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  57.56 
 
 		 769 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  46.81 
 
 		 758 aa  653    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  45.72 
 
 		 754 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  55.61 
 
 		 758 aa  807    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  60.69 
 
 		 769 aa  937    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  61.89 
 
 		 771 aa  928    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  56.18 
 
 		 769 aa  800    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  62.35 
 
 		 767 aa  940    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  60.98 
 
 		 772 aa  907    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  64.77 
 
 		 760 aa  987    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  61.37 
 
 		 779 aa  955    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  61.51 
 
 		 772 aa  951    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  64.98 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  56.71 
 
 		 769 aa  792    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  64.98 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  56.91 
 
 		 765 aa  833    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  59.47 
 
 		 777 aa  908    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  62.09 
 
 		 773 aa  975    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  64.02 
 
 		 774 aa  929    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  54.4 
 
 		 759 aa  823    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  45.38 
 
 		 766 aa  647    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  48.79 
 
 		 754 aa  665    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  63.08 
 
 		 785 aa  949    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  64.05 
 
 		 756 aa  979    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  50.27 
 
 		 752 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  59.31 
 
 		 770 aa  873    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4030  malic enzyme  47.13 
 
 		 761 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  50.86 
 
 		 757 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  70.56 
 
 		 755 aa  1093    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  55.44 
 
 		 759 aa  832    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  45.56 
 
 		 751 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  64.69 
 
 		 776 aa  1016    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  60.48 
 
 		 764 aa  945    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2760  malic enzyme  48.97 
 
 		 753 aa  647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3020  malic enzyme  47.66 
 
 		 761 aa  643    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  64.79 
 
 		 756 aa  985    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  62.95 
 
 		 766 aa  947    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  59.71 
 
 		 766 aa  902    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  64.98 
 
 		 756 aa  994    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  64.05 
 
 		 756 aa  979    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  63.08 
 
 		 785 aa  949    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  59.31 
 
 		 766 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  49.6 
 
 		 757 aa  688    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  61.79 
 
 		 769 aa  940    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  61.66 
 
 		 769 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>