More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1343 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  77.19 
 
 
513 aa  814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  77.19 
 
 
513 aa  814    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  77.39 
 
 
526 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  81.46 
 
 
509 aa  866    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  99.81 
 
 
519 aa  1067    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  77.19 
 
 
513 aa  814    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  100 
 
 
519 aa  1068    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  82.35 
 
 
511 aa  879    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  100 
 
 
519 aa  1068    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  77.39 
 
 
526 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  77 
 
 
513 aa  812    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  88.57 
 
 
516 aa  946    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  77.19 
 
 
513 aa  814    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  81.5 
 
 
509 aa  865    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  76.8 
 
 
513 aa  811    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  77.19 
 
 
513 aa  814    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  77.19 
 
 
513 aa  814    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  77.39 
 
 
526 aa  817    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  77.39 
 
 
526 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  78.36 
 
 
513 aa  843    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  82.75 
 
 
511 aa  883    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  77.19 
 
 
513 aa  814    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  77.39 
 
 
513 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  52.3 
 
 
500 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  53.66 
 
 
501 aa  511  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  53.85 
 
 
501 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  52.03 
 
 
501 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  51.45 
 
 
516 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  50.6 
 
 
520 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  45.34 
 
 
509 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  44.08 
 
 
508 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  43.15 
 
 
500 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  42.54 
 
 
501 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  45 
 
 
506 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  42.32 
 
 
500 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  42.39 
 
 
526 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  41.98 
 
 
506 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  41.87 
 
 
500 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  42.74 
 
 
500 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  41.9 
 
 
500 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  41.46 
 
 
500 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  41.87 
 
 
500 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.65 
 
 
498 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  41.98 
 
 
501 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.65 
 
 
498 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  42.57 
 
 
497 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.65 
 
 
498 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  41.81 
 
 
508 aa  364  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  41.91 
 
 
500 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  43.14 
 
 
501 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  41.81 
 
 
508 aa  360  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  43.32 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  38.97 
 
 
503 aa  355  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0131  Ppx/GppA phosphatase  42.51 
 
 
499 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.96 
 
 
498 aa  353  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.87 
 
 
498 aa  353  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  42.11 
 
 
499 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  41.67 
 
 
498 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.56 
 
 
498 aa  349  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  43.95 
 
 
505 aa  349  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  39.92 
 
 
503 aa  349  8e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  40.37 
 
 
505 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  41.08 
 
 
499 aa  347  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1589  Ppx/GppA phosphatase  38.96 
 
 
520 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  40.56 
 
 
508 aa  341  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  38.68 
 
 
504 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  38.48 
 
 
504 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.12 
 
 
500 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1732  Ppx/GppA phosphatase  45.21 
 
 
517 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  38.48 
 
 
504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  40.12 
 
 
497 aa  339  7e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.75 
 
 
494 aa  339  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2185  exopolyphosphatase  41.53 
 
 
518 aa  339  9e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  39.55 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.55 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.55 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.55 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  38.28 
 
 
504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  39.34 
 
 
494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  39.34 
 
 
494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  38.28 
 
 
504 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  38.28 
 
 
504 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.34 
 
 
494 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  38.28 
 
 
504 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.34 
 
 
494 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0889  Ppx/GppA phosphatase  38.14 
 
 
535 aa  336  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0340211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  38.08 
 
 
504 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  38.08 
 
 
504 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  38.08 
 
 
504 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  38.08 
 
 
504 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  38.08 
 
 
504 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  38.08 
 
 
504 aa  335  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  38.08 
 
 
504 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1274  Ppx/GppA phosphatase  38.28 
 
 
509 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635217  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  38.08 
 
 
504 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  40.95 
 
 
505 aa  334  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  39.39 
 
 
497 aa  333  5e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2850  Ppx/GppA phosphatase  38.51 
 
 
503 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542299  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2208  Ppx/GppA phosphatase  41.32 
 
 
518 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.620115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2285  Ppx/GppA phosphatase  41.32 
 
 
518 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>