82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1315 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  88.33 
 
 		 2795 aa  3152    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  37.56 
 
 		 4953 aa  794    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  39.02 
 
 		 2933 aa  771    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  36.27 
 
 		 5337 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 1976 aa  3836    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.74 
 
 		 1417 aa  522  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  30.1 
 
 		 2367 aa  523  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  30.1 
 
 		 2358 aa  523  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  30.1 
 
 		 2383 aa  523  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  29.94 
 
 		 2358 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  30.01 
 
 		 2620 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  33.63 
 
 		 1417 aa  516  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  33.71 
 
 		 1396 aa  512  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  34.35 
 
 		 1418 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  33.61 
 
 		 1417 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  33.51 
 
 		 2933 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  30.09 
 
 		 2296 aa  496  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  30.65 
 
 		 1746 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  39.31 
 
 		 969 aa  486  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  41.82 
 
 		 941 aa  483  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  36.47 
 
 		 1084 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  38.41 
 
 		 4672 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  34.68 
 
 		 1075 aa  439  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  34.87 
 
 		 1050 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  34.87 
 
 		 1075 aa  437  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  36.68 
 
 		 934 aa  384  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  35.43 
 
 		 730 aa  293  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  35.43 
 
 		 730 aa  293  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  37.66 
 
 		 730 aa  293  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  35.43 
 
 		 730 aa  293  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  35.43 
 
 		 730 aa  280  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  37.4 
 
 		 724 aa  277  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  49.04 
 
 		 410 aa  272  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  37.04 
 
 		 690 aa  251  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  242  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  50 
 
 		 292 aa  242  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  34.34 
 
 		 497 aa  220  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  33.42 
 
 		 474 aa  212  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  33.42 
 
 		 509 aa  211  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  33.77 
 
 		 476 aa  209  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  33.77 
 
 		 464 aa  210  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  33.77 
 
 		 476 aa  210  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  33.77 
 
 		 464 aa  209  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  33.77 
 
 		 464 aa  210  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  33.77 
 
 		 464 aa  209  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  33.42 
 
 		 474 aa  209  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  33.42 
 
 		 474 aa  209  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.45 
 
 		 468 aa  209  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  33.77 
 
 		 417 aa  208  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  33.77 
 
 		 417 aa  208  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  33.51 
 
 		 464 aa  206  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  206  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  30.85 
 
 		 660 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  31.11 
 
 		 660 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  30.92 
 
 		 660 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  30.69 
 
 		 660 aa  166  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  30.18 
 
 		 660 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  30.56 
 
 		 3209 aa  151  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  30.58 
 
 		 1459 aa  130  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  24.41 
 
 		 543 aa  82  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  25.72 
 
 		 1279 aa  79  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  27.84 
 
 		 7434 aa  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1164 aa  77  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  24.82 
 
 		 1361 aa  73.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  28.86 
 
 		 1224 aa  63.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  28.86 
 
 		 1224 aa  63.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  26.1 
 
 		 1209 aa  56.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  29.2 
 
 		 614 aa  56.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  29.34 
 
 		 2625 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  26.1 
 
 		 1209 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  28.9 
 
 		 1237 aa  55.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  29.19 
 
 		 1224 aa  51.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  34.11 
 
 		 372 aa  51.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  27 
 
 		 4480 aa  50.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  31.93 
 
 		 302 aa  50.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  31.59 
 
 		 638 aa  48.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  27.21 
 
 		 830 aa  47.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  26.29 
 
 		 3562 aa  48.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  26.22 
 
 		 4830 aa  47  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  25.42 
 
 		 851 aa  46.2  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  27.03 
 
 		 818 aa  45.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  26.22 
 
 		 3864 aa  45.8  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>