More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1094 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  99.26 
 
 
271 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  99.63 
 
 
271 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  93.36 
 
 
271 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  90.04 
 
 
271 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  90.41 
 
 
271 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  90.04 
 
 
271 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  90.04 
 
 
271 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  90.04 
 
 
271 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  90.04 
 
 
271 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  90.41 
 
 
271 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  90.41 
 
 
271 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.3 
 
 
271 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.67 
 
 
271 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.3 
 
 
271 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.3 
 
 
271 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.3 
 
 
271 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.3 
 
 
271 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.3 
 
 
271 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  89.67 
 
 
271 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  88.93 
 
 
271 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  86.35 
 
 
271 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  88.19 
 
 
271 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  68.27 
 
 
271 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  62.96 
 
 
271 aa  362  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  66.79 
 
 
269 aa  361  7.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.53 
 
 
269 aa  360  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01200  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.53 
 
 
269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1776  lipoprotein, YaeC family  61.25 
 
 
271 aa  351  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.67 
 
 
271 aa  348  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3984  YaeC family lipoprotein  68.75 
 
 
270 aa  341  8e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  66.8 
 
 
270 aa  337  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0427  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 
275 aa  330  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  61.85 
 
 
272 aa  328  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0039  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  61.85 
 
 
272 aa  328  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  61.85 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  61.85 
 
 
272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  61.85 
 
 
272 aa  326  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  61.85 
 
 
272 aa  326  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.121383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03544  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  61.85 
 
 
272 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  61.85 
 
 
272 aa  325  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  61.85 
 
 
266 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4116  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  60.64 
 
 
272 aa  319  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0742418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  53.96 
 
 
276 aa  300  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  56.2 
 
 
281 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.2 
 
 
272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.2 
 
 
272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.2 
 
 
272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.2 
 
 
272 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.2 
 
 
272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  55.79 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  59.03 
 
 
262 aa  253  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  54.96 
 
 
272 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.04 
 
 
267 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  49.04 
 
 
267 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  49.08 
 
 
271 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  49.08 
 
 
271 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  49.08 
 
 
271 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  49.08 
 
 
271 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  49.08 
 
 
271 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  52.3 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  49.08 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  47.62 
 
 
271 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  48.59 
 
 
275 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  46.1 
 
 
266 aa  241  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  50.38 
 
 
270 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  47.33 
 
 
286 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50 
 
 
270 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  47.51 
 
 
258 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  47.51 
 
 
258 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  46.51 
 
 
259 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  53.14 
 
 
270 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  45.72 
 
 
264 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  48.31 
 
 
271 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  46.12 
 
 
259 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  52.52 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  53.39 
 
 
529 aa  235  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  49.8 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  50.94 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  47.28 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  52.1 
 
 
268 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  50.21 
 
 
262 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  49.37 
 
 
258 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  51.27 
 
 
260 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  46.74 
 
 
258 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  49.63 
 
 
270 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  49.63 
 
 
266 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  49.63 
 
 
266 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  48.55 
 
 
259 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  44.44 
 
 
259 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  44.44 
 
 
259 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  50.63 
 
 
265 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  49.07 
 
 
274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.01 
 
 
268 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  48.29 
 
 
265 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  46.06 
 
 
257 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  54.67 
 
 
260 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  50.38 
 
 
264 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  48.78 
 
 
268 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  46.77 
 
 
269 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>