More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1035 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
290 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  87.29 
 
 
290 aa  517  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.7 
 
 
289 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  83.68 
 
 
287 aa  494  1e-138  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  81.31 
 
 
289 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.04 
 
 
287 aa  481  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  80.14 
 
 
291 aa  465  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  80.14 
 
 
291 aa  465  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  80.14 
 
 
291 aa  465  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  79.79 
 
 
291 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  79.79 
 
 
291 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.98602e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  79.04 
 
 
290 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.74 
 
 
291 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0543  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  66.43 
 
 
285 aa  394  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  66.9 
 
 
273 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  66.32 
 
 
273 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  65.85 
 
 
271 aa  377  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  64.08 
 
 
283 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.72 
 
 
280 aa  325  4e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.09 
 
 
290 aa  320  2e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.86 
 
 
287 aa  319  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.05 
 
 
303 aa  314  1e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.74 
 
 
296 aa  312  3e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
301 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.6 
 
 
267 aa  309  3e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  308  6e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.39 
 
 
296 aa  308  6e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.21 
 
 
270 aa  308  8e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.16 
 
 
298 aa  305  5e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.01 
 
 
301 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.8 
 
 
296 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.8 
 
 
296 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.69 
 
 
300 aa  304  1e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.69 
 
 
300 aa  304  1e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.87 
 
 
266 aa  301  6e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.52 
 
 
266 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.45 
 
 
268 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.09 
 
 
296 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.9 
 
 
269 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.68 
 
 
301 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.9 
 
 
269 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.9 
 
 
269 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.08 
 
 
268 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.08 
 
 
268 aa  295  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.04 
 
 
268 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.04 
 
 
268 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.74 
 
 
268 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.74 
 
 
268 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.19 
 
 
269 aa  294  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.93 
 
 
270 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.93 
 
 
270 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.11 
 
 
270 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0834  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.16 
 
 
297 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.4 
 
 
276 aa  288  5e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.93 
 
 
268 aa  289  5e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.3 
 
 
268 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.21 
 
 
271 aa  286  3e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.93 
 
 
269 aa  286  3e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.65 
 
 
265 aa  285  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.06 
 
 
270 aa  284  1e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.76 
 
 
266 aa  282  5e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.24 
 
 
262 aa  281  9e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.3 
 
 
261 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.94 
 
 
261 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.36 
 
 
292 aa  272  4e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.53 
 
 
265 aa  271  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.36 
 
 
294 aa  269  3e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.36 
 
 
294 aa  270  3e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.12 
 
 
264 aa  269  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.71 
 
 
294 aa  269  5e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.75 
 
 
256 aa  266  3e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.14 
 
 
248 aa  266  3e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.93 
 
 
289 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.35 
 
 
263 aa  265  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.39 
 
 
256 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.18 
 
 
269 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.3 
 
 
267 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.93 
 
 
261 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
271 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.14 
 
 
275 aa  260  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.3 
 
 
267 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.99 
 
 
285 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.94 
 
 
266 aa  258  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.67119e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>