67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0842 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3346  hypothetical protein  99.47 
 
 
187 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0842  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000365146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0840  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  357  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4023  hypothetical protein  73.96 
 
 
170 aa  271  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000235855  decreased coverage  0.000372984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0505  hypothetical protein  70.83 
 
 
170 aa  258  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3348  hypothetical protein  70.37 
 
 
165 aa  248  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000288279  decreased coverage  0.00213814 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3906  hypothetical protein  71.17 
 
 
170 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000939538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3708  hypothetical protein  71.17 
 
 
170 aa  245  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000576402  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4247  hypothetical protein  65.91 
 
 
183 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3287  hypothetical protein  69.75 
 
 
165 aa  243  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.717112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0548  hypothetical protein  67.27 
 
 
170 aa  243  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000220186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0751  protein of unknown function DUF335 SprT  69.75 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.067857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02774  hypothetical protein  69.75 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3102  hypothetical protein  69.75 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3086  hypothetical protein  69.75 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0374593  hitchhiker  0.00021739 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02737  hypothetical protein  69.75 
 
 
165 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3376  hypothetical protein  69.14 
 
 
165 aa  241  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3339  hypothetical protein  67.9 
 
 
165 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00105383  normal  0.150558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3331  hypothetical protein  67.9 
 
 
165 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10575  normal  0.425008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3266  hypothetical protein  67.9 
 
 
165 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.005885  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3255  hypothetical protein  67.9 
 
 
165 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000006136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3435  hypothetical protein  67.9 
 
 
165 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0526499  hitchhiker  0.00365775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0770  hypothetical protein  69.59 
 
 
151 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000227359  hitchhiker  0.0000931266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002465  protein SprT  49.38 
 
 
165 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03570  hypothetical protein  50.31 
 
 
165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0551  hypothetical protein  50.64 
 
 
161 aa  171  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0023  hypothetical protein  50.66 
 
 
162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3970  protein of unknown function DUF335, SprT  48.37 
 
 
191 aa  161  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0602  protein of unknown function DUF335 SprT  45 
 
 
188 aa  158  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1624  hypothetical protein  51.77 
 
 
169 aa  158  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2368  protein of unknown function DUF335, SprT  47.56 
 
 
176 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0781299  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0545  protein of unknown function DUF335, SprT  44.64 
 
 
203 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3159  protein of unknown function DUF335, SprT  47.13 
 
 
219 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000619203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3222  protein of unknown function DUF335, SprT  45.22 
 
 
203 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00097264  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0843  protein of unknown function DUF335 SprT  46.5 
 
 
218 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0209179  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3524  hypothetical protein  46.5 
 
 
218 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4132  protein of unknown function DUF335 SprT  42.86 
 
 
212 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0811  protein of unknown function DUF335 SprT  46.5 
 
 
219 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000376161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3442  hypothetical protein  44.23 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000887757  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0834  hypothetical protein  43.62 
 
 
206 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0836  protein of unknown function DUF335 SprT  46.1 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00977603  hitchhiker  0.0000107184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2972  hypothetical protein  42.77 
 
 
219 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0692  hypothetical protein  43.23 
 
 
201 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000345273  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3330  hypothetical protein  43.23 
 
 
201 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0277435  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3228  protein of unknown function DUF335, SprT  41.29 
 
 
162 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01642  hypothetical protein  41.56 
 
 
151 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0577  sprT protein, putative  44.22 
 
 
184 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00218492  normal  0.10682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2229  protein of unknown function DUF335 SprT  39.1 
 
 
174 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354031  normal  0.796923 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0864  hypothetical protein  40.88 
 
 
188 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4190  hypothetical protein  33.74 
 
 
165 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2966  hypothetical protein  34.36 
 
 
164 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0041354  normal  0.102756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49060  hypothetical protein  32.93 
 
 
165 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203632  hitchhiker  0.000000135384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1201  hypothetical protein  35 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3706  hypothetical protein  33.95 
 
 
164 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1683  peptidase, SprT family  36.05 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.781786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4234  hypothetical protein  33.95 
 
 
164 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33250  hypothetical protein  35.56 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.115665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1639  hypothetical protein  33.75 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4078  hypothetical protein  33.75 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1241  hypothetical protein  32.69 
 
 
164 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000128773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0324  protein of unknown function DUF335 SprT  37.12 
 
 
196 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0077532  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1552  protein of unknown function DUF335, SprT  35.61 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0472621  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1712  protein of unknown function DUF335, SprT  32.65 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0501  hypothetical protein  31.14 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000572187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1875  hypothetical protein  46.88 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1439  protein of unknown function SprT  39.22 
 
 
193 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0451  hypothetical protein  38.1 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>