254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0707 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0238  flagellar switch protein  99.27 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.137291  normal  0.0537834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0627  flagellar motor switch protein FliN  98.54 
 
 		 137 aa  270  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  65.43 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  62.07 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04968  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  62.5 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001181  flagellar motor switch protein FliN  57.5 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4421  flagellar motor switch protein FliN  50.98 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.465417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  47.96 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  39.17 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  38.33 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.68 
 
 		 122 aa  84.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4649  flagellar motor switch protein FliN  49.41 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519755  normal  0.588244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  46.34 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  41.49 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  37.5 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0217  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  48.24 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  37.5 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  39.84 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  46.84 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  53.03 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  34.96 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  42.05 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  45.12 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  36.67 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  36.44 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  34.4 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  34.4 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  53.03 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  53.03 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  52.94 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  34.4 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  42.05 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  44.94 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  38.68 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  34.4 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  37.74 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  46.05 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  43.9 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  46.05 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  48.65 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  48.48 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  43.53 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.83 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  39.39 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  46.05 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  51.52 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  41.67 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  44.44 
 
 		 155 aa  76.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  48.48 
 
 		 139 aa  76.6  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  48.53 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  48.53 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  50 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  44.87 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  50 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  50 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  33.04 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  44.59 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  33.04 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  45.45 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  42.17 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  39.53 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  32.46 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.57 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  32.46 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  35.65 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  36.46 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  35.65 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  42.35 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  51.52 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>