121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0602 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  45.12 
 
 
211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  42.86 
 
 
223 aa  174  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  39.62 
 
 
223 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  36.67 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  37.25 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  35.61 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  37.1 
 
 
218 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  36.92 
 
 
224 aa  125  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  36.11 
 
 
218 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  34.3 
 
 
221 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  35.81 
 
 
222 aa  123  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  36.11 
 
 
218 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0272  hypothetical protein  34.13 
 
 
212 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  29.72 
 
 
230 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  30.54 
 
 
224 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  33.82 
 
 
224 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  28.16 
 
 
220 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  30.24 
 
 
226 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  29.19 
 
 
223 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  30.24 
 
 
238 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  30.24 
 
 
240 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  32.86 
 
 
224 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  33.96 
 
 
221 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  32.38 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  31.71 
 
 
206 aa  99.4  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  32.21 
 
 
227 aa  98.2  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  30.26 
 
 
212 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  31.43 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  31.73 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  31.73 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  31.73 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  29.27 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  31.73 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  30.95 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  29.56 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  30.48 
 
 
240 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  28.22 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  28.22 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  31.73 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  31.28 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  31.28 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  31.28 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  30.95 
 
 
249 aa  95.1  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  28.22 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  30.48 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  30.48 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  30.48 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  30.48 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  30.48 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  27.78 
 
 
263 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  31.25 
 
 
226 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  32.41 
 
 
240 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  33.18 
 
 
225 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  27.27 
 
 
224 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  31.25 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  27.01 
 
 
216 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  32.06 
 
 
226 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  29.05 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  92  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  33.02 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  28.91 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  30 
 
 
580 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  27.86 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  28.44 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  27.27 
 
 
208 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  32.39 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  27.78 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  26.67 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  27.45 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  26.67 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  26.21 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  26.67 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  25.77 
 
 
206 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  25.13 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  29.91 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  26.29 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  31.16 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  24.74 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  29.95 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  28.24 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  25.6 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  28.97 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  28.57 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  28.57 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  28.57 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  26.34 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  24.02 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4342  YheO domain-containing protein  25.12 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  25.36 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>