More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0486 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  73.85 
 
 		 484 aa  736    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0265  succinic semialdehyde dehydrogenase  74.23 
 
 		 484 aa  723    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  100 
 
 		 489 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  1006    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  62.29 
 
 		 479 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2470  succinic semialdehyde dehydrogenase  65.41 
 
 		 483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 483 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.09 
 
 		 493 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.72 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.17 
 
 		 486 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.05 
 
 		 482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.05 
 
 		 482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 		 493 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.05 
 
 		 482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 484 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.21 
 
 		 485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.05 
 
 		 482 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.41 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.2 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.57 
 
 		 500 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 		 509 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.5 
 
 		 486 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.96 
 
 		 485 aa  559  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 		 490 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.41 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.58 
 
 		 496 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.2 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.53 
 
 		 483 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  55.77 
 
 		 482 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  55.77 
 
 		 482 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.77 
 
 		 482 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.77 
 
 		 482 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.86 
 
 		 489 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.17 
 
 		 486 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3225  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.87 
 
 		 486 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00532289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.56 
 
 		 489 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.96 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.85 
 
 		 488 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.99 
 
 		 489 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.77 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.79 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  56.77 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 491 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 489 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.83 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 489 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.24 
 
 		 493 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 489 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.35 
 
 		 492 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.96 
 
 		 489 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 489 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.62 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.47 
 
 		 483 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.17 
 
 		 492 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.86 
 
 		 483 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.1 
 
 		 488 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.74 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.47 
 
 		 483 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.18 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  55.24 
 
 		 491 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.18 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.2 
 
 		 484 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.08 
 
 		 481 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1290  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.99 
 
 		 482 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.82 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.04 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.18 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.86 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  54.18 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.72 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.86 
 
 		 482 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.65 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.65 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.16 
 
 		 484 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.44 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.2 
 
 		 484 aa  531  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 		 484 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.33 
 
 		 480 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5862  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.62 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.24 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  55.25 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.83 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.82 
 
 		 482 aa  534  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.82 
 
 		 480 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4518  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.45 
 
 		 486 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  55.27 
 
 		 480 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.99 
 
 		 490 aa  529  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0598  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.32 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.62 
 
 		 486 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0833  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.23 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.405715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  58.06 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.46 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.12 
 
 		 486 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>