46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0392 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  48.6 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  48.04 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  53.18 
 
 		 173 aa  187  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  46.93 
 
 		 174 aa  187  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  51.43 
 
 		 174 aa  187  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  46.93 
 
 		 174 aa  185  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  46.37 
 
 		 174 aa  184  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  49.71 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  43.6 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  45.4 
 
 		 190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  45.35 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  33.53 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  31.29 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  26.63 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  33.09 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  27.21 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  26.06 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  26.96 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  30.97 
 
 		 265 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  30.1 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  30.97 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  25.33 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  28.46 
 
 		 265 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  23.89 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  25.17 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  23.93 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.97 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  30.6 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  30.6 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  24.83 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  27.46 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  25.66 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  30.6 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.23 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.36 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  21.48 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  25.45 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  25.77 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  24.73 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>