43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0388 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.71 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  45 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  44.29 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  35.51 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  35.88 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  35.88 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  37.69 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  38.62 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  33.8 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.09 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  35.16 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.58 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  33.59 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  37.86 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  34.35 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  33.6 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  32.06 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  33.98 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  31.45 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  26.52 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.27 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  26.52 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  26.21 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  34.48 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  28.24 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  28.46 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  28.06 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0020  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  23.93 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  24.78 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0607  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0718  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0741  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  33.71 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  32.11 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  33.71 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  33.71 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>