127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0363 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0292  homoserine O-succinyltransferase  100 
 
 		 309 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0637  homoserine O-succinyltransferase  100 
 
 		 309 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.35705  normal  0.0503855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0363  homoserine O-succinyltransferase  100 
 
 		 309 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4504  homoserine O-succinyltransferase  89.32 
 
 		 309 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295159  hitchhiker  0.00456401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0364  homoserine O-succinyltransferase  86.73 
 
 		 309 aa  573  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3780  homoserine O-succinyltransferase  86.41 
 
 		 309 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3959  homoserine O-succinyltransferase  86.41 
 
 		 309 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0449  homoserine O-succinyltransferase  84.47 
 
 		 309 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4467  homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.0469066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5483  homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03885  homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3984  Homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4247  homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4555  homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  527  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.628604  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03845  hypothetical protein  79.61 
 
 		 309 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.400251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4017  homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.149933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4507  homoserine O-succinyltransferase  79.61 
 
 		 309 aa  527  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4518  homoserine O-succinyltransferase  79.29 
 
 		 309 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4515  homoserine O-succinyltransferase  79.29 
 
 		 309 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4393  homoserine O-succinyltransferase  79.29 
 
 		 309 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.442234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4428  homoserine O-succinyltransferase  79.29 
 
 		 309 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4591  homoserine O-succinyltransferase  79.29 
 
 		 309 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0217  homoserine O-succinyltransferase  77.67 
 
 		 309 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0394319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1216  homoserine O-succinyltransferase  69.44 
 
 		 319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.350697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2499  homoserine O-succinyltransferase  65.57 
 
 		 312 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0019  homoserine O-succinyltransferase  65.42 
 
 		 306 aa  420  1e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003633  homoserine O-succinyltransferase  64.59 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02491  homoserine O-succinyltransferase  65.25 
 
 		 313 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0112  homoserine O-succinyltransferase  57.81 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.9309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2598  homoserine O-succinyltransferase  55.59 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00675576  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2665  homoserine O-succinyltransferase  55.59 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00279787  normal  0.638831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2772  homoserine O-succinyltransferase  55.41 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1374  homoserine O-succinyltransferase  55.74 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.968831  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2551  homoserine O-succinyltransferase  56.07 
 
 		 321 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1395  homoserine O-succinyltransferase  56.25 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0631633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1676  homoserine O-succinyltransferase  55.92 
 
 		 313 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2588  homoserine O-succinyltransferase  54.4 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0439713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3021  homoserine O-succinyltransferase  56.48 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1336  homoserine O-succinyltransferase  55.23 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1493  homoserine O-succinyltransferase  55.92 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.112065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1488  homoserine O-succinyltransferase  55.92 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.256727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2784  homoserine O-succinyltransferase  53.95 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0176984  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1524  homoserine O-succinyltransferase  55.92 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.153444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2858  homoserine O-succinyltransferase  55.92 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  hitchhiker  0.000000000557635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3204  homoserine O-succinyltransferase  54.43 
 
 		 314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0264716  unclonable  0.0000000200152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1472  homoserine O-succinyltransferase  54.43 
 
 		 314 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02861  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0294  homoserine O-succinyltransferase  51.83 
 
 		 313 aa  348  7e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1100  homoserine O-succinyltransferase  53.11 
 
 		 315 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3331  homoserine O-succinyltransferase  53.44 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00132184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1956  homoserine O-succinyltransferase  54.82 
 
 		 311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1845  homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000102531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2925  homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1078  Homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.1303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1189  homoserine O-succinyltransferase  49.34 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0733  homoserine O-succinyltransferase  48.38 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0258153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0046  homoserine O-succinyltransferase  49.84 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0046  homoserine O-succinyltransferase  49.84 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3924  homoserine O-succinyltransferase  49.83 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0654032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5584  homoserine O-succinyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  316  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.019403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5423  homoserine O-succinyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5534  homoserine O-succinyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.57848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5257  homoserine O-succinyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5198  homoserine O-succinyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5500  homoserine O-succinyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5103  homoserine O-succinyltransferase  48.84 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.205196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1567  homoserine O-succinyltransferase  50.33 
 
 		 302 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5086  homoserine O-succinyltransferase  48.5 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00854912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15020  homoserine O-succinyltransferase  48.17 
 
 		 304 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00909944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2599  homoserine O-succinyltransferase  50.5 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3162  homoserine O-succinyltransferase  49.17 
 
 		 312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5528  homoserine O-succinyltransferase  47.84 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4581  homoserine O-succinyltransferase  50.16 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5655  homoserine O-succinyltransferase  48.75 
 
 		 279 aa  292  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0075  homoserine O-succinyltransferase  46.67 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1379  homoserine O-succinyltransferase  42.3 
 
 		 312 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0371  homoserine O-succinyltransferase  46.28 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3489  homoserine O-succinyltransferase  42.95 
 
 		 306 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4134  homoserine O-succinyltransferase  42.53 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2166  homoserine O-succinyltransferase  41.97 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3805  homoserine O-succinyltransferase  42.3 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0424  homoserine O-succinyltransferase  41.97 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0486  homoserine O-succinyltransferase  41.97 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3030  homoserine O-succinyltransferase  43 
 
 		 323 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.436733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0010  homoserine O-succinyltransferase  43 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1640  homoserine O-succinyltransferase  43 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.35195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4253  homoserine O-succinyltransferase  42.52 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3083  homoserine O-succinyltransferase  42.39 
 
 		 312 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0141  homoserine O-succinyltransferase  44.04 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.711356 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4499  homoserine O-succinyltransferase  42.67 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1130  homoserine O-succinyltransferase  44.37 
 
 		 344 aa  265  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1593  homoserine O-succinyltransferase  40.98 
 
 		 305 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695076  normal  0.229155 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0280  homoserine O-succinyltransferase  41.58 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0684  homoserine O-succinyltransferase  43.19 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.965727  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1894  homoserine O-succinyltransferase  45.07 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0022  homoserine O-succinyltransferase  45.07 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0586  homoserine O-succinyltransferase  41.2 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.60384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2351  homoserine O-succinyltransferase  40.39 
 
 		 313 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412479  normal  0.146068 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7783  homoserine O-succinyltransferase  41.03 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07521  putative homoserine O-succinyltransferase  35.79 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0386472 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>