More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0310 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  286  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  80.71 
 
 		 143 aa  243  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  74.81 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  74.81 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  74.81 
 
 		 141 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  74.07 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  74.07 
 
 		 141 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  72.59 
 
 		 141 aa  210  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  69.63 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  53.38 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  52.67 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  51.13 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  50.72 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  51.15 
 
 		 157 aa  139  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  51.52 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  51.15 
 
 		 177 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 		 176 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 		 176 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 		 171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  50.38 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  47.79 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  48.09 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  46.46 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  44.7 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  44.7 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  47.33 
 
 		 139 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  44.7 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  46.62 
 
 		 132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.41 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  41.61 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  41.04 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 143 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  37.69 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  37.5 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  40.77 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  38.46 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.23 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  37.59 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.53 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.53 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  40.77 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  39.26 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.53 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  38.69 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 157 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.15 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.36 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  36.88 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  38.06 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 172 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  38.52 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>