More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0129 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0129  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4026  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0285  hypothetical protein  88.42 
 
 
286 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5597  hypothetical protein  84.91 
 
 
286 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1033  hypothetical protein  84.1 
 
 
286 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  42.81 
 
 
284 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.46 
 
 
284 aa  235  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.75 
 
 
286 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.61 
 
 
283 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  40.64 
 
 
284 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  40.21 
 
 
284 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  41.7 
 
 
284 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1995  ketose-bisphosphate aldolase  39.78 
 
 
281 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.46 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  40.57 
 
 
278 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1492  fructose-bisphosphate aldolase  40.85 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00472623  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  41.92 
 
 
286 aa  214  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  41.92 
 
 
286 aa  214  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  43.01 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  47.02 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  41.92 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  42.66 
 
 
287 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  41.34 
 
 
284 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  42.76 
 
 
284 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  41.11 
 
 
285 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0323  hypothetical protein  42.05 
 
 
287 aa  205  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2749  ketose-bisphosphate aldolase  40.78 
 
 
287 aa  205  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  41.46 
 
 
285 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  40.91 
 
 
285 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0504  ketose-bisphosphate aldolase  43.72 
 
 
277 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.205506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0331  hypothetical protein  41.7 
 
 
286 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.220687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  40.77 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  38.81 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  37.5 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  43.86 
 
 
288 aa  198  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3993  hypothetical protein  42.2 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  38.52 
 
 
283 aa  195  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  36.4 
 
 
283 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  38.65 
 
 
281 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  38.25 
 
 
281 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  37.89 
 
 
281 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  39.65 
 
 
283 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  38.65 
 
 
281 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  38.65 
 
 
281 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.5 
 
 
313 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  38.52 
 
 
284 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4019  ketose-bisphosphate aldolase  38.25 
 
 
283 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  38.52 
 
 
284 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  40.08 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  43.51 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  39.27 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.17 
 
 
313 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  38.52 
 
 
284 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0081  fructose-bisphosphate aldolase  42.74 
 
 
281 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2750  ketose-bisphosphate aldolase  38.52 
 
 
293 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  38.91 
 
 
284 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  38.91 
 
 
284 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  38.91 
 
 
284 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1230  ketose-bisphosphate aldolase  42.29 
 
 
283 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000139711  normal  0.0508866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  38.91 
 
 
284 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  38.55 
 
 
284 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0455  fructose-bisphosphate aldolase  36.46 
 
 
412 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0616426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  38.55 
 
 
284 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  37.06 
 
 
286 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4035  ketose-bisphosphate aldolase  39.13 
 
 
295 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  38.55 
 
 
284 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01742  predicted aldolase  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.665846  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  37.06 
 
 
286 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  37.06 
 
 
286 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1869  ketose-bisphosphate aldolase  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00279551  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01730  hypothetical protein  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.843477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  37.06 
 
 
286 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  37.94 
 
 
307 aa  185  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  37.06 
 
 
286 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  37.06 
 
 
286 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  37.06 
 
 
286 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1997  fructose-bisphosphate aldolase, class II  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1857  fructose-bisphosphate aldolase  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00760876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2497  fructose-bisphosphate aldolase, class II family  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1859  ketose-bisphosphate aldolase  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.175434  decreased coverage  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  37.06 
 
 
286 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1418  fructose-bisphosphate aldolase  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  37.06 
 
 
292 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2058  fructose-bisphosphate aldolase, class II  38.75 
 
 
278 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  hitchhiker  0.00173454 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  36.51 
 
 
330 aa  185  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  38.55 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1650  Tagatose-bisphosphate aldolase  38.58 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  40.34 
 
 
309 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  38.51 
 
 
307 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  38.03 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  38.72 
 
 
316 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  38.21 
 
 
281 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0616  fructose/tagatose bisphosphate aldolase, class II  36.43 
 
 
281 aa  178  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.128722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>