28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0097 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0097  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4065  F5/8 type C domain-containing protein  99.37 
 
 		 159 aa  323  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4066  F5/8 type C domain-containing protein  99.37 
 
 		 159 aa  322  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.639135 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  67.09 
 
 		 159 aa  226  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  65.82 
 
 		 159 aa  223  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  36.67 
 
 		 748 aa  95.5  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  34.68 
 
 		 768 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  34.11 
 
 		 912 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  31.94 
 
 		 818 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  28.47 
 
 		 873 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.97 
 
 		 1246 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  28.8 
 
 		 674 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 524 aa  57.4  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.03 
 
 		 712 aa  53.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  29.52 
 
 		 1070 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.26 
 
 		 695 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  28.57 
 
 		 1439 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  24.26 
 
 		 552 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.27 
 
 		 478 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  28.33 
 
 		 1581 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  29 
 
 		 576 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.29 
 
 		 1158 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 986 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.81 
 
 		 820 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  28.57 
 
 		 2095 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  26.87 
 
 		 2095 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.53 
 
 		 1564 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  25 
 
 		 1103 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>