201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0080 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03396  predicted metal dependent hydrolase  63.6 
 
 
563 aa  758    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4017  phosphoethanolamine transferase  62.41 
 
 
563 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.363242  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0166  sulfatase  63.6 
 
 
563 aa  758    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0170  phosphoethanolamine transferase  63.6 
 
 
563 aa  758    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3957  phosphoethanolamine transferase  62.41 
 
 
563 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00895606  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0131  phosphoethanolamine transferase  79.72 
 
 
564 aa  937    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.173638  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0080  phosphoethanolamine transferase  100 
 
 
563 aa  1172    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4490  phosphoethanolamine transferase  75.58 
 
 
559 aa  904    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.950688  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3913  phosphoethanolamine transferase  62.41 
 
 
563 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291921  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4916  phosphoethanolamine transferase  63.24 
 
 
563 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3835  phosphoethanolamine transferase  62.59 
 
 
563 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00912049  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0178  phosphoethanolamine transferase  63.13 
 
 
563 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.11544  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4207  phosphoethanolamine transferase  74.87 
 
 
560 aa  880    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4081  phosphoethanolamine transferase  100 
 
 
563 aa  1172    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4143  phosphoethanolamine transferase  69.8 
 
 
560 aa  835    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.617131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3747  phosphoethanolamine transferase  63.6 
 
 
563 aa  758    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03347  hypothetical protein  63.6 
 
 
563 aa  758    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3983  phosphoethanolamine transferase  63.78 
 
 
563 aa  758    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4041  phosphoethanolamine transferase  63.78 
 
 
563 aa  758    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3867  phosphoethanolamine transferase  63.78 
 
 
563 aa  758    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3848  phosphoethanolamine transferase  62.59 
 
 
563 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.632743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4133  phosphoethanolamine transferase  99.29 
 
 
563 aa  1162    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.257424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1859  phosphoethanolamine transferase  55.33 
 
 
554 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  27.49 
 
 
544 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000583  hypothetical protein  26.9 
 
 
551 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  27.75 
 
 
544 aa  176  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05289  lipid A phosphoethanolamine transferase  27.51 
 
 
550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1048  sulfatase  26.37 
 
 
580 aa  173  9e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6033  sulfatase  26.98 
 
 
580 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.218752 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1161  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  26.93 
 
 
576 aa  170  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  27.13 
 
 
544 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  26.06 
 
 
568 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  28.94 
 
 
565 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  28.94 
 
 
565 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  28.94 
 
 
565 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  28.94 
 
 
565 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  28.19 
 
 
557 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2103  sulfatase  25.63 
 
 
541 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  27.12 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4592  hypothetical protein  26.8 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1245  sulfatase  26.64 
 
 
572 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.761831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1454  sulfatase  26.42 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4122  sulfatase  26.46 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1296  hypothetical protein  27.04 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  26.7 
 
 
547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1871  sulfatase  25.27 
 
 
541 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.754116  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1783  sulfatase  26.47 
 
 
552 aa  163  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.349972  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  26.83 
 
 
535 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1854  inner membrane protein  27.08 
 
 
552 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.458981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04472  inner membrane protein  28.39 
 
 
532 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  26.74 
 
 
572 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2048  hypothetical protein  25.49 
 
 
541 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3130  sulfatase  25.32 
 
 
564 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2228  sulfatase  25.13 
 
 
541 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4248  lipid A phosphoethanolamine transferase  26.06 
 
 
508 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.973235  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2326  sulfatase  25.59 
 
 
547 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1810  hypothetical protein  28.34 
 
 
551 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  26.23 
 
 
552 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1916  sulfatase  24.63 
 
 
545 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.725859  normal  0.322218 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  26.33 
 
 
551 aa  157  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  25.99 
 
 
544 aa  157  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1562  sulfatase  26.94 
 
 
558 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0048353  hitchhiker  0.00604368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3478  sulfatase  25.5 
 
 
541 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3812  sulfatase  28.51 
 
 
549 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0194754  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3085  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  28.12 
 
 
549 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1387  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  24.51 
 
 
549 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  27.26 
 
 
549 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2091  protein of unknown function DUF1705  25.72 
 
 
541 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0178711  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2254  hypothetical protein  25.72 
 
 
541 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2371  hypothetical protein  25.72 
 
 
541 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00897064  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2097  sulfatase  24.6 
 
 
541 aa  154  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21210  hypothetical protein  28.4 
 
 
551 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2103  hypothetical protein  25.72 
 
 
541 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0341  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  28.18 
 
 
532 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2041  hypothetical protein  25.09 
 
 
542 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.017573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1718  sulfatase  26.42 
 
 
588 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  27.19 
 
 
545 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3435  sulfatase  26.21 
 
 
560 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0021  sulfatase  28.54 
 
 
524 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  26.5 
 
 
552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1167  hypothetical protein  33.67 
 
 
557 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  28.7 
 
 
555 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  24.87 
 
 
547 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  24.87 
 
 
547 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  24.87 
 
 
547 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  25.17 
 
 
547 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  24.73 
 
 
544 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2995  sulfatase  27.77 
 
 
549 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00588254  normal  0.0336769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1228  sulfatase  25.87 
 
 
569 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  25.05 
 
 
545 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  24.55 
 
 
543 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3047  lipid A phosphoethanolamine transferase  24.8 
 
 
506 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0141  hypothetical protein  27.05 
 
 
502 aa  144  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  25.05 
 
 
547 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5584  hypothetical protein  24.8 
 
 
549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  26.71 
 
 
531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0088  type III effector HopAH2-2  22.55 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000528702  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  25 
 
 
539 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1955  sulfatase  32.81 
 
 
589 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.822176  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2204  putative cell division protein  26.46 
 
 
545 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00407882  hitchhiker  0.00021657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>