136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0079 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0620  hypothetical protein  62.45 
 
 		 487 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4082  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  992    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0124  hypothetical protein  69.92 
 
 		 482 aa  726    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.962224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4134  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  992    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0079  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  992    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1042  hypothetical protein  63.89 
 
 		 487 aa  636    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0015  hypothetical protein  61.78 
 
 		 493 aa  618  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2037  hypothetical protein  56.6 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0462564  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  59.48 
 
 		 541 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1229  hypothetical protein  55.51 
 
 		 491 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0454  hypothetical protein  49.9 
 
 		 523 aa  494  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000520171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  51.2 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1760  lysophospholipase-like protein  40.52 
 
 		 479 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2656  hypothetical protein  37.15 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1805  hypothetical protein  36.46 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347902  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2541  hypothetical protein  36.86 
 
 		 492 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2579  hypothetical protein  36.05 
 
 		 492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.247206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1804  hypothetical protein  34.38 
 
 		 489 aa  279  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1544  lysophospholipase-like protein  36.15 
 
 		 499 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.7787  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2316  hypothetical protein  36.54 
 
 		 488 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2789  hypothetical protein  34.25 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2244  hypothetical protein  36.89 
 
 		 488 aa  266  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0117248  normal  0.0610259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2436  hypothetical protein  36.94 
 
 		 488 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1553  hypothetical protein  34.02 
 
 		 493 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0111304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1466  hypothetical protein  34.51 
 
 		 525 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.385052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2024  hypothetical protein  36.75 
 
 		 408 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1434  hypothetical protein  32.23 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  27.12 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3325  putative lipoprotein  25 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0114  hypothetical protein  26.96 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0985  putative lipoprotein  23.99 
 
 		 397 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  34.13 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3337  phospholipase/carboxylesterase  31.54 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  29.49 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  27.31 
 
 		 252 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  27.01 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  32.04 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0233  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03278  phospholipase/Carboxylesterase  24.51 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.235294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  27.73 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 261 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  28.71 
 
 		 254 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  32 
 
 		 253 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 230 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  33.7 
 
 		 271 aa  54.3  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  28.91 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2699  phospholipase/Carboxylesterase  22.47 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0730  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 271 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153643  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.14 
 
 		 736 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3417  phospholipase/Carboxylesterase  22.47 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48400  hypothetical protein  30.51 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00598917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  29.37 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 306 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  32.56 
 
 		 250 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  22.57 
 
 		 246 aa  50.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 254 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  28.35 
 
 		 316 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  33.33 
 
 		 308 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 278 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  45.65 
 
 		 254 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  26.72 
 
 		 313 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  29.41 
 
 		 258 aa  50.4  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  35.56 
 
 		 271 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  24.34 
 
 		 246 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  24.34 
 
 		 246 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  26.27 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.9 
 
 		 736 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  27.5 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  30.77 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  32.97 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 257 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  36.78 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  30.4 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  25.83 
 
 		 267 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  38.82 
 
 		 229 aa  48.5  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  25.83 
 
 		 267 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  30.65 
 
 		 333 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 288 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 299 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  27.35 
 
 		 263 aa  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1212  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 344 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  29.29 
 
 		 227 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 287 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  26.27 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  26.27 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  26.27 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  26.27 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  26.27 
 
 		 272 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  27.12 
 
 		 339 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  26.27 
 
 		 277 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  32.56 
 
 		 257 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  27.35 
 
 		 270 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>