More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0075 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0075  pyridoxal-phosphate dependent protein  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.560403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4139  pyridoxal-phosphate dependent protein  100 
 
 		 314 aa  212  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0110645  normal  0.0292289 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4087  pyridoxal-phosphate dependent protein  100 
 
 		 314 aa  212  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2166  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  73.83 
 
 		 312 aa  173  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0413  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  57.69 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  41 
 
 		 297 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  43.43 
 
 		 293 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  40.4 
 
 		 293 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 298 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  41.58 
 
 		 303 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 288 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  39.81 
 
 		 303 aa  84.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  40.59 
 
 		 303 aa  83.6  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  41.84 
 
 		 298 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  40.59 
 
 		 303 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 300 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 300 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  39.39 
 
 		 303 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  39.22 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  39.81 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  39.81 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  39.81 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  40.59 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  39.81 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 292 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.3 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  39.81 
 
 		 308 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  40.4 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2239  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226796 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  40.78 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  41.84 
 
 		 292 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  38.32 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  40.82 
 
 		 292 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  40.82 
 
 		 292 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  38.32 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  40.82 
 
 		 292 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  43.14 
 
 		 302 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  38 
 
 		 305 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  38.32 
 
 		 300 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 301 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  39.25 
 
 		 325 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  37.76 
 
 		 295 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  37.86 
 
 		 297 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  41.41 
 
 		 329 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  38.38 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  35.35 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  36.36 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1109  cysteine synthase  40 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0380662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  37.86 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2921  cysteine synthase A  40 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.328533  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  36.36 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2771  cysteine synthase A  40 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  38.83 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  39.39 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  38.38 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  40.4 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  38.83 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  37.86 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  35.35 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  40.4 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1605  O-acetylserine (thiol)-lyase  40.2 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  42.42 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  41.18 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 299 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  37.86 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  37.86 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  38.38 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  37.37 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  38.38 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>