More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0069 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  99.7 
 
 		 335 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  99.4 
 
 		 335 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  100 
 
 		 335 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  65.18 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  66.77 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  52.9 
 
 		 317 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  52.9 
 
 		 317 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  51.53 
 
 		 317 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  48.25 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  44.66 
 
 		 323 aa  260  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  51.22 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  45.21 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  45.16 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.09 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  44.98 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  45.14 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 		 316 aa  222  8e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  45.21 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  41.95 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  43.1 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  42.03 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  41.67 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  43.52 
 
 		 346 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.64 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  39.06 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  38.41 
 
 		 354 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  38.41 
 
 		 354 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  38.41 
 
 		 354 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 354 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  38.41 
 
 		 354 aa  205  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  38.41 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  37.86 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  41.84 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  38.77 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  38.07 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  38.63 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  44.52 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  41.24 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.2 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  40.88 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  37.86 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  36.04 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  38.7 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  36.17 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  37.72 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  35.67 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  41.44 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  41.44 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  32.46 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.87 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  33.66 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  33.66 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  35.21 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  34.86 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  34.86 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  25.61 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  26.09 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  24.26 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  24.26 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  25.72 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  25.72 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  25.72 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  25.72 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  25.72 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  25.72 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  25.72 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  25.36 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  28.8 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  28.8 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  26.09 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  32.26 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  27.21 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  23.27 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.68 
 
 		 694 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  27.33 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  25.63 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  23.46 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1395  iron compound ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  22.91 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  22.91 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  22.91 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  22.91 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  22.78 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  35.29 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  24.35 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  28.07 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>