182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0051 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  99.46 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  100 
 
 		 185 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  97.84 
 
 		 185 aa  337  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  40.64 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  39.78 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  39.78 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  39.78 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  38.59 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  38.37 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  35.71 
 
 		 195 aa  97.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  37.11 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  37.11 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  37.11 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  37.11 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  37.11 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  37.11 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  35.38 
 
 		 196 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  34.18 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  34.64 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  32.22 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  33.67 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  34.76 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  34.18 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.93 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  32.22 
 
 		 174 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  32.22 
 
 		 174 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  32.22 
 
 		 174 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  34.57 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  34.57 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  34.57 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  34.57 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  34.57 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  34.57 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  36.81 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  34.16 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30.81 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  36.9 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  36.9 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  36.9 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  35.9 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  35.9 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  35.9 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  35.9 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  35.9 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  36.2 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  36.2 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.52 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.35 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  29.35 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  29.35 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  27.88 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  29.35 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  31.33 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  29.35 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  33.54 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  33.54 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  33.54 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  30.9 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  30.85 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  29.35 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  29.35 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  29.35 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  29.35 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30.9 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30.9 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30.9 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30.9 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.83 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.83 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.83 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.4 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  30.57 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  29.83 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  31.58 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  31.58 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  26.82 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  31.58 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  31.05 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  31.05 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  31.05 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  31.05 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  33.54 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  29.61 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  31.05 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  32.48 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  28 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  30.06 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  30.06 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.29 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  32.93 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>