274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0027 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_4164  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  81.94 
 
 
382 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4127  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  99.74 
 
 
387 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3779  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  99.74 
 
 
387 aa  787    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0027  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  100 
 
 
387 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0073  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  85.38 
 
 
383 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.804562  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0053  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  80.63 
 
 
383 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4446  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  80.89 
 
 
382 aa  628  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03455  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.18 
 
 
382 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0106  Mannitol dehydrogenase domain protein  75.92 
 
 
382 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0112  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.92 
 
 
382 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03406  hypothetical protein  76.18 
 
 
382 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3933  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.18 
 
 
382 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4099  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.92 
 
 
382 aa  589  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3807  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.92 
 
 
382 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4017  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.65 
 
 
382 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4970  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  75.65 
 
 
382 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3902  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  74.61 
 
 
382 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.970231  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4071  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  74.61 
 
 
382 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.541542  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4009  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  74.61 
 
 
382 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3886  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  74.87 
 
 
382 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3964  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  74.61 
 
 
382 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866494  normal  0.811691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0135  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  74.87 
 
 
387 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.947643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0089  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  64.92 
 
 
382 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0195  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.01 
 
 
384 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2814  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  58.9 
 
 
382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001633  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  59.89 
 
 
382 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.917395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00833  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  59.63 
 
 
382 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1251  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  57.29 
 
 
383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1384  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.39 
 
 
381 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00167811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3409  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  44.56 
 
 
381 aa  342  5e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000437999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2794  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  46.04 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0056  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  42.71 
 
 
384 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3788  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  42.78 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0271  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  38.02 
 
 
388 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4003  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  43.99 
 
 
384 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05975  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase (M1PDH)(MPDH)(MPD)(EC 1.1.1.17) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0F5]  38.01 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0030  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  35.73 
 
 
388 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07050  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  43.44 
 
 
379 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0223  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.66 
 
 
383 aa  252  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2191  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  38.02 
 
 
368 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2229  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  38.02 
 
 
368 aa  250  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3835  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.96 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.361477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1848  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  35.45 
 
 
376 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3209  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  32.21 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  29.64 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0032  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase, putative  24.42 
 
 
334 aa  114  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.49746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  29.17 
 
 
498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  26.87 
 
 
490 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  28.91 
 
 
499 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  28.08 
 
 
486 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  29.55 
 
 
488 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.33 
 
 
497 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.28 
 
 
490 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  28.28 
 
 
490 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  28.91 
 
 
488 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  28.28 
 
 
452 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.37 
 
 
431 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  28.91 
 
 
488 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  28.12 
 
 
486 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.12 
 
 
486 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  28.12 
 
 
486 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0601  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.18 
 
 
452 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  28.91 
 
 
488 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2406  mannitol dehydrogenase domain protein  29.44 
 
 
482 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0249546  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  28.12 
 
 
486 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  28.91 
 
 
488 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  28.04 
 
 
497 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.69 
 
 
486 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  28.57 
 
 
486 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  27.73 
 
 
486 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  27.31 
 
 
486 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  26.8 
 
 
488 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.55 
 
 
495 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.72 
 
 
495 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  30.71 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  27.34 
 
 
487 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.53 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.49 
 
 
505 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  28.46 
 
 
520 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.31 
 
 
490 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.09 
 
 
493 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.3 
 
 
490 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
497 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  27.06 
 
 
488 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 
488 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  27.36 
 
 
485 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  27.97 
 
 
482 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.63 
 
 
483 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  27.06 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.1 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  27.12 
 
 
497 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  28.28 
 
 
496 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  27.8 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  27.8 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.8 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  27.8 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  26.97 
 
 
464 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  27.17 
 
 
459 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.48 
 
 
486 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>