160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0020 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  313  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  97.35 
 
 		 151 aa  306  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  97.35 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  60 
 
 		 152 aa  166  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  54.79 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  52.05 
 
 		 157 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  50.34 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  46.94 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  46.94 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  46.94 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  46.94 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  46.94 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0166  hypothetical protein  44.52 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4927  hypothetical protein  44.52 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3751  hypothetical protein  44.52 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4046  hypothetical protein  44.52 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03400  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  43.84 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03351  hypothetical protein  43.84 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3975  hypothetical protein  43.15 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3872  hypothetical protein  43.15 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  38.28 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 		 291 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  42.42 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.33 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  31.29 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  36.15 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  36.15 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  36.64 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0329  putative acetyltransferase  34.35 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  35.61 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  34.35 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  34.35 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  33.59 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  32.82 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  32.82 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  32.82 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  32.82 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  32.82 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3747  GCN5-related N-acetyltransferase  33.86 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  31.45 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  35.11 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1722  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00703201  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  29.77 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2662  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.362327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.326397  normal  0.640285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2628  GCN5-related N-acetyltransferase  27.48 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  25.36 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0855  GNAT family acetyltransferase  27.41 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  30.88 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3024  acetyltransferase  29.6 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2972  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0451042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1192  acetyltransferase  33.59 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.261009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.22282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  26.98 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  27.92 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6588  hypothetical protein  25.95 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1226  hypothetical protein  53.66 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0669955  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4020  acetyltransferase, GNAT family  27.07 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  28.19 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.627337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>