83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2262 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  98.97 
 
 		 584 aa  1186    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  73.21 
 
 		 532 aa  843    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 606 aa  1244    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  51.79 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  48.21 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  48.91 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  47.24 
 
 		 484 aa  481  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  45.54 
 
 		 515 aa  465  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  42.09 
 
 		 537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  45.61 
 
 		 495 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  37 
 
 		 534 aa  342  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  35.43 
 
 		 555 aa  306  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  38.94 
 
 		 663 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  35.07 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 516 aa  298  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  35.54 
 
 		 798 aa  289  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  32.66 
 
 		 540 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  35.15 
 
 		 483 aa  260  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  31.38 
 
 		 731 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  30.21 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  31.33 
 
 		 490 aa  206  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  31.33 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 463 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  30.83 
 
 		 478 aa  194  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  30.26 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  31.57 
 
 		 500 aa  190  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  30.38 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  30.92 
 
 		 473 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.94 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  29.9 
 
 		 492 aa  161  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  27.6 
 
 		 627 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  28.53 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  26.94 
 
 		 473 aa  143  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  29.1 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 479 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  28.76 
 
 		 446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  26.57 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  25.98 
 
 		 429 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  25.54 
 
 		 581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  24.59 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  25.42 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.67 
 
 		 644 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  32.24 
 
 		 464 aa  99  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  30.77 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  37.5 
 
 		 474 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  24.94 
 
 		 711 aa  92.8  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  35.29 
 
 		 452 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  36.64 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  32.34 
 
 		 596 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  32.65 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  33.85 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  29.89 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  28.06 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  34.96 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  28.27 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.98 
 
 		 674 aa  75.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  30.51 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  33.85 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  26.97 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  29.73 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  31.33 
 
 		 474 aa  67  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  26.81 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  31.3 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  30.65 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.7 
 
 		 687 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.79 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.38 
 
 		 704 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  38.67 
 
 		 690 aa  53.9  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  33.94 
 
 		 704 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  21.34 
 
 		 463 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  36 
 
 		 698 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  33.7 
 
 		 434 aa  50.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  23.05 
 
 		 410 aa  50.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.81 
 
 		 467 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  22.84 
 
 		 638 aa  50.4  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.14 
 
 		 688 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  39.19 
 
 		 460 aa  47.4  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  39.19 
 
 		 460 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  33.33 
 
 		 581 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  30.67 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  25.77 
 
 		 932 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  25.15 
 
 		 750 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.5 
 
 		 709 aa  43.9  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>