26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2222 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  100 
 
 		 723 aa  1498    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  63.28 
 
 		 720 aa  946    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  65.09 
 
 		 719 aa  969    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  45.14 
 
 		 710 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  40.11 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  29.39 
 
 		 726 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  29.39 
 
 		 726 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  29.5 
 
 		 830 aa  210  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 		 830 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  26.38 
 
 		 824 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  29.04 
 
 		 660 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  26.8 
 
 		 662 aa  88.6  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  27.2 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  23.41 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  25.61 
 
 		 677 aa  73.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.5 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  24.81 
 
 		 601 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  21.88 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  23.69 
 
 		 615 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  26.18 
 
 		 619 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  22.98 
 
 		 588 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  23.08 
 
 		 632 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  21.58 
 
 		 625 aa  45.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.77 
 
 		 607 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  23.56 
 
 		 1136 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  21.77 
 
 		 616 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>