282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2210 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  63.03 
 
 		 551 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  98.75 
 
 		 559 aa  1091    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1105    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  58.17 
 
 		 564 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 581 aa  193  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 585 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  34.08 
 
 		 591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 556 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  32.77 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  31.93 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 575 aa  160  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.22 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.77 
 
 		 571 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  39.06 
 
 		 584 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  38.65 
 
 		 573 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  38.13 
 
 		 590 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 		 573 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  40.08 
 
 		 573 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  30.11 
 
 		 562 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 586 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  38.13 
 
 		 575 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  38.31 
 
 		 573 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  29.43 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  29.23 
 
 		 642 aa  141  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.6 
 
 		 645 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  29.6 
 
 		 645 aa  140  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 		 572 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  43.95 
 
 		 606 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.69 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 616 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  43.31 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  43.31 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  43.31 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  43.31 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  43.31 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  43.31 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  43.31 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  38 
 
 		 619 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  41.06 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  40.4 
 
 		 613 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  29.07 
 
 		 635 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  40.25 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  42.05 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  40.25 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  40.25 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  39.46 
 
 		 609 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 607 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 607 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  34.94 
 
 		 620 aa  117  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  36.07 
 
 		 616 aa  116  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  40.82 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 599 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  31.84 
 
 		 603 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.84 
 
 		 553 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  33.73 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  38 
 
 		 494 aa  109  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 584 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 593 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  41.67 
 
 		 566 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 595 aa  104  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  35.29 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 603 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  29.75 
 
 		 583 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 562 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 594 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 572 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 617 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 579 aa  96.7  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  36.47 
 
 		 572 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  40.58 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  29.76 
 
 		 619 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  30.36 
 
 		 587 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 592 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  30.8 
 
 		 625 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 566 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  37.31 
 
 		 425 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  28.78 
 
 		 593 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 592 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.18 
 
 		 594 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 642 aa  90.5  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 622 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  36.05 
 
 		 677 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 585 aa  87.8  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 595 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  24.76 
 
 		 632 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.83 
 
 		 566 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  35.81 
 
 		 621 aa  81.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>