More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2193 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  99.35 
 
 
155 aa  314  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04527  30S ribosomal protein S7  92.9 
 
 
155 aa  299  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000390925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  89.17 
 
 
157 aa  289  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  226  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  66.45 
 
 
155 aa  224  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2376  30S ribosomal protein S7  73.1 
 
 
156 aa  223  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000622465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  223  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  223  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  65.16 
 
 
155 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  63.87 
 
 
155 aa  221  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 
156 aa  219  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 
156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  216  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  216  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  215  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4552  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  214  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  214  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  214  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  213  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  213  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 
156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  210  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  63.29 
 
 
158 aa  209  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  63.06 
 
 
157 aa  209  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  62.82 
 
 
156 aa  209  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  209  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  208  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  208  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  208  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  207  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0275  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  207  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000213948  unclonable  0.0000000969286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  207  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
157 aa  207  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  207  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  206  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 
157 aa  206  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  204  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0291  30S ribosomal protein S7  61.78 
 
 
157 aa  205  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  204  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  204  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0493  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  204  3e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  204  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  204  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  203  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  203  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  203  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3677  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000012423  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0276  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000211572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  202  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2778  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  201  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  202  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  202  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  202  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  202  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  201  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  200  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  200  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  200  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  200  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  200  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  200  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  200  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  200  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>