171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2062 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 98 aa  199  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  96.47 
 
 		 93 aa  167  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  63.64 
 
 		 66 aa  87.4  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  62.12 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.47 
 
 		 68 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.94 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  48.39 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.45 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.62 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.97 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.97 
 
 		 347 aa  57.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.47 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.89 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  57  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  42.42 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2729  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3709  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3007  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3225  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1774  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3680  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3738  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2779  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0314  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.71 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 326 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0390  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2696  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0411  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  38.81 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  43.28 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0329  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 374 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3509  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.20038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 162 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 211 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2773  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0338  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518448  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  40.91 
 
 		 331 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0073  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.1 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0384  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0093  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.704796  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1564  ThiS, thiamine-biosynthesis  42.42 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0619282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46 
 
 		 327 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0731  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.38 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  37.31 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3574  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>