More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2005 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  100 
 
 		 882 aa  1800    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  54.71 
 
 		 849 aa  867    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  48.32 
 
 		 902 aa  775    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  43.59 
 
 		 881 aa  678    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  97.05 
 
 		 882 aa  1659    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  71.04 
 
 		 889 aa  1265    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  47.14 
 
 		 904 aa  715    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  46 
 
 		 898 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  42.48 
 
 		 893 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  40.07 
 
 		 875 aa  628  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  34.71 
 
 		 864 aa  515  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  34.44 
 
 		 886 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  34.8 
 
 		 966 aa  396  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  45.97 
 
 		 717 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 831 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  44.32 
 
 		 733 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  47.64 
 
 		 905 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.29 
 
 		 712 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  33.18 
 
 		 914 aa  355  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.15 
 
 		 814 aa  344  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  30.05 
 
 		 972 aa  340  8e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  32.37 
 
 		 915 aa  335  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  31.61 
 
 		 999 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 913 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  42.93 
 
 		 763 aa  292  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  30.29 
 
 		 823 aa  291  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  29.41 
 
 		 857 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  28.82 
 
 		 897 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  28.28 
 
 		 870 aa  287  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.24 
 
 		 839 aa  282  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  28.75 
 
 		 832 aa  279  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.25 
 
 		 866 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  27.89 
 
 		 884 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  28.17 
 
 		 906 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.55 
 
 		 820 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  27.14 
 
 		 913 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  27.28 
 
 		 913 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  28.49 
 
 		 833 aa  262  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  28.31 
 
 		 887 aa  261  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  27.38 
 
 		 845 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  29.34 
 
 		 772 aa  255  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  26.41 
 
 		 843 aa  249  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.72 
 
 		 813 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  28.51 
 
 		 838 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  26.09 
 
 		 851 aa  242  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  26.66 
 
 		 839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  28.65 
 
 		 850 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  35.7 
 
 		 803 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  35.89 
 
 		 1548 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  39.51 
 
 		 874 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.27 
 
 		 1212 aa  234  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  26.11 
 
 		 843 aa  229  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  29.5 
 
 		 897 aa  226  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.06 
 
 		 1357 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  36.61 
 
 		 747 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.7 
 
 		 1343 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  35.48 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  35.48 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  35.48 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.47 
 
 		 756 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  35 
 
 		 755 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  35 
 
 		 765 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  36.38 
 
 		 928 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  33.47 
 
 		 768 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  28.57 
 
 		 832 aa  215  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.25 
 
 		 765 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  35.25 
 
 		 765 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  35.25 
 
 		 765 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  35.25 
 
 		 765 aa  214  7e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  35.25 
 
 		 765 aa  214  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  35.25 
 
 		 765 aa  214  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  35.25 
 
 		 765 aa  214  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  35.25 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  35.25 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.07 
 
 		 974 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  39.28 
 
 		 952 aa  213  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.91 
 
 		 988 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  34.84 
 
 		 763 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  34.12 
 
 		 772 aa  211  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  34.84 
 
 		 763 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  34.59 
 
 		 763 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35668  beta-xylosidase  35.41 
 
 		 682 aa  208  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  34.59 
 
 		 763 aa  208  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  27.34 
 
 		 852 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 763 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.27 
 
 		 762 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  37.19 
 
 		 875 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  37.53 
 
 		 949 aa  206  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.5 
 
 		 927 aa  205  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  28.66 
 
 		 818 aa  204  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  38.75 
 
 		 790 aa  204  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  36.74 
 
 		 811 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.4 
 
 		 923 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  25.34 
 
 		 894 aa  201  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.42 
 
 		 778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  42.96 
 
 		 764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  35.78 
 
 		 934 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  42.59 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  34.41 
 
 		 774 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.16 
 
 		 778 aa  196  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>