211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2004 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  47.02 
 
 
875 aa  808    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  42.69 
 
 
864 aa  698    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  97.87 
 
 
891 aa  1764    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.08 
 
 
872 aa  780    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  70.36 
 
 
860 aa  1294    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  100 
 
 
891 aa  1821    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 
863 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  37.41 
 
 
871 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.63 
 
 
842 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  36.63 
 
 
861 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.92 
 
 
845 aa  469  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  33.01 
 
 
813 aa  464  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.81 
 
 
845 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.85 
 
 
813 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  31.76 
 
 
802 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  32.85 
 
 
819 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  33.37 
 
 
819 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  36.19 
 
 
786 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  33.29 
 
 
824 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 
785 aa  422  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  32.55 
 
 
802 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  32.02 
 
 
815 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  33.33 
 
 
819 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 
897 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  34.43 
 
 
833 aa  398  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  34 
 
 
812 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  33.33 
 
 
839 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  30.27 
 
 
837 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  32.74 
 
 
840 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 
793 aa  379  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  32.9 
 
 
846 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  31.28 
 
 
829 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  32.31 
 
 
823 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.33 
 
 
843 aa  363  8e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.18 
 
 
835 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  31.33 
 
 
824 aa  353  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.17 
 
 
818 aa  343  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  33.46 
 
 
799 aa  339  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  29.21 
 
 
847 aa  335  2e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  30.96 
 
 
831 aa  335  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.72 
 
 
817 aa  330  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.41 
 
 
843 aa  326  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  28.41 
 
 
838 aa  320  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  33.18 
 
 
880 aa  314  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  30.53 
 
 
837 aa  308  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  40.34 
 
 
663 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.48 
 
 
940 aa  260  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  26.01 
 
 
845 aa  233  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 
763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  26.59 
 
 
856 aa  171  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.66 
 
 
882 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 
816 aa  167  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  26.55 
 
 
882 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  26.77 
 
 
839 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  26.56 
 
 
839 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  26.77 
 
 
839 aa  159  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  26.77 
 
 
839 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  27.2 
 
 
828 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  27.2 
 
 
828 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  26.77 
 
 
839 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  26.77 
 
 
839 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  26.77 
 
 
839 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  27.2 
 
 
828 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  24.03 
 
 
821 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 
853 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  26.82 
 
 
839 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  25.92 
 
 
827 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  26.63 
 
 
816 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.17 
 
 
962 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.76 
 
 
984 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  26.74 
 
 
825 aa  138  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  26.56 
 
 
812 aa  138  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.04 
 
 
734 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.43 
 
 
826 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.17 
 
 
826 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 
1144 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.94 
 
 
971 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.42 
 
 
744 aa  121  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  23.02 
 
 
820 aa  120  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.65 
 
 
878 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  29.33 
 
 
811 aa  109  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.6 
 
 
815 aa  104  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.9 
 
 
720 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  25.1 
 
 
739 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 
724 aa  87.8  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 
906 aa  77.8  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.24 
 
 
1362 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.81 
 
 
1033 aa  70.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  23.24 
 
 
1008 aa  69.7  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
987 aa  68.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.35 
 
 
858 aa  66.2  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  22 
 
 
1028 aa  65.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.93 
 
 
799 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
888 aa  64.7  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.16 
 
 
1108 aa  64.7  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  22.17 
 
 
1063 aa  64.3  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  23.73 
 
 
889 aa  63.9  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.8 
 
 
621 aa  62.4  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  20.1 
 
 
1013 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  21.68 
 
 
1084 aa  61.6  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>