176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2003 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 812 aa  1650    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  97.17 
 
 		 812 aa  1561    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  66.98 
 
 		 736 aa  1013    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.8 
 
 		 821 aa  631  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.3 
 
 		 785 aa  571  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.8 
 
 		 781 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.01 
 
 		 618 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.35 
 
 		 613 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.73 
 
 		 634 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.77 
 
 		 790 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.98 
 
 		 762 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.81 
 
 		 795 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.42 
 
 		 772 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  35.93 
 
 		 777 aa  389  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.01 
 
 		 609 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.09 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.35 
 
 		 526 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  35.25 
 
 		 795 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.84 
 
 		 775 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.46 
 
 		 542 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.58 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.44 
 
 		 605 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  36.33 
 
 		 776 aa  369  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.32 
 
 		 779 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.96 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.42 
 
 		 905 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.4 
 
 		 774 aa  358  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 		 766 aa  358  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.86 
 
 		 505 aa  349  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.07 
 
 		 534 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 		 618 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.51 
 
 		 613 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.51 
 
 		 527 aa  333  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.39 
 
 		 779 aa  331  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.49 
 
 		 765 aa  330  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.04 
 
 		 834 aa  321  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.23 
 
 		 760 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.12 
 
 		 534 aa  314  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.28 
 
 		 546 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.21 
 
 		 469 aa  308  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.98 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.44 
 
 		 422 aa  300  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  36.58 
 
 		 637 aa  294  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  36.09 
 
 		 639 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  41.06 
 
 		 614 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  36.15 
 
 		 639 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.32 
 
 		 628 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 		 525 aa  283  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  35.87 
 
 		 543 aa  281  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.75 
 
 		 545 aa  281  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.87 
 
 		 549 aa  277  6e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.71 
 
 		 665 aa  274  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.88 
 
 		 529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.99 
 
 		 447 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  37.47 
 
 		 602 aa  267  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.1 
 
 		 481 aa  262  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.88 
 
 		 547 aa  260  6e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  32.97 
 
 		 639 aa  250  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.49 
 
 		 688 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.22 
 
 		 515 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.14 
 
 		 636 aa  248  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.43 
 
 		 627 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.16 
 
 		 636 aa  241  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.47 
 
 		 504 aa  241  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.75 
 
 		 794 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 		 558 aa  238  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.8 
 
 		 639 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.57 
 
 		 688 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.49 
 
 		 493 aa  235  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.88 
 
 		 584 aa  233  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.36 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.53 
 
 		 593 aa  232  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  36.3 
 
 		 1140 aa  231  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.98 
 
 		 816 aa  224  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.14 
 
 		 797 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 		 528 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 		 858 aa  221  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.29 
 
 		 525 aa  220  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.19 
 
 		 811 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 		 676 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.88 
 
 		 673 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 		 673 aa  208  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.6 
 
 		 820 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.03 
 
 		 778 aa  205  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.07 
 
 		 807 aa  203  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.86 
 
 		 518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 		 533 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.95 
 
 		 500 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.73 
 
 		 866 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.45 
 
 		 852 aa  185  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.1 
 
 		 868 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 		 489 aa  180  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28 
 
 		 857 aa  173  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05690  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.26 
 
 		 476 aa  173  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.83 
 
 		 863 aa  171  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.02 
 
 		 530 aa  171  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 		 885 aa  164  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  25.83 
 
 		 883 aa  160  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  26.55 
 
 		 881 aa  160  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01265  hypothetical protein  23.9 
 
 		 883 aa  160  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>