156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1977 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1977  outer membrane protein  100 
 
 
218 aa  438  1e-122  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  6.71005e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1909  OmpW family protein  98.62 
 
 
218 aa  434  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  1.71006e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03097  outer membrane protein  46.41 
 
 
228 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3523  OmpW family protein  48.64 
 
 
211 aa  184  1e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.11983  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1334  outer membrane protein W  30.7 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  28.45 
 
 
210 aa  79.3  4e-14  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  30.98 
 
 
202 aa  76.3  4e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  31.37 
 
 
216 aa  76.3  4e-13  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  30.53 
 
 
211 aa  75.1  7e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  30.53 
 
 
211 aa  75.1  7e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  29.81 
 
 
210 aa  73.9  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  30.09 
 
 
211 aa  73.9  2e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1052  OmpW  32.47 
 
 
211 aa  73.2  3e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2674  outer membrane protein W  28.88 
 
 
223 aa  72.8  4e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69515e-05 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1326  OmpW family outer membrane protein  32.29 
 
 
209 aa  72.8  4e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0285584  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1823  OmpW family protein  27.32 
 
 
209 aa  70.9  1e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219711  hitchhiker  1.60297e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  30.26 
 
 
217 aa  70.1  2e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1743  outer membrane protein W  27.97 
 
 
212 aa  69.7  3e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  8.20415e-07  hitchhiker  0.000840764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1425  outer membrane protein W  27.97 
 
 
212 aa  69.7  3e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0528971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  28.25 
 
 
210 aa  69.7  3e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1414  outer membrane protein W  27.97 
 
 
212 aa  69.7  4e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0785515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4566  OmpW family protein  33.02 
 
 
230 aa  68.9  5e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1469  outer membrane protein W  26.22 
 
 
215 aa  68.2  8e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  9.00043e-07  hitchhiker  6.43724e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1365  outer membrane protein W  29.29 
 
 
212 aa  68.2  9e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0200008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2371  outer membrane protein W  29.29 
 
 
212 aa  68.2  9e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.535822  hitchhiker  1.60145e-06 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01230  outer membrane protein W  29.29 
 
 
212 aa  68.2  9e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2392  OmpW family protein  29.29 
 
 
212 aa  68.2  9e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01240  hypothetical protein  29.29 
 
 
212 aa  68.2  9e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1876  outer membrane protein W  28.87 
 
 
212 aa  67  2e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.62717e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  29.68 
 
 
210 aa  65.5  7e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  29.52 
 
 
227 aa  64.3  1e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1236  OmpW family protein  32.87 
 
 
203 aa  64.7  1e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  29.52 
 
 
227 aa  64.3  1e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  26.96 
 
 
215 aa  63.2  3e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.83878e-07  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  29.75 
 
 
210 aa  63.5  3e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  26.96 
 
 
215 aa  63.2  3e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.1484e-07  decreased coverage  5.56975e-08 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2283  outer membrane protein W  25.78 
 
 
211 aa  62.8  4e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  24.15 
 
 
224 aa  62.8  4e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  27.88 
 
 
213 aa  62.4  5e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1414  outer membrane protein W  29 
 
 
212 aa  62  6e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.157023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  28.19 
 
 
215 aa  62  6e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  28.99 
 
 
214 aa  62.4  6e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  1.2731e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  28.99 
 
 
215 aa  62  7e-09  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  6.49255e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2775  outer membrane protein W  27.78 
 
 
218 aa  61.6  8e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00794049  decreased coverage  2.09029e-05 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  26.63 
 
 
267 aa  61.6  9e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  26.96 
 
 
215 aa  60.8  1e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  28.57 
 
 
213 aa  61.2  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  28.02 
 
 
214 aa  61.2  1e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  3.87398e-05  unclonable  1.73343e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  27.14 
 
 
214 aa  61.6  1e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  25.87 
 
 
210 aa  60.8  1e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1596  outer membrane protein W  28.38 
 
 
212 aa  60.5  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.597068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  27.53 
 
 
206 aa  60.1  2e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1859  outer membrane protein W  28.38 
 
 
212 aa  60.5  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  27.54 
 
 
214 aa  59.7  3e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  27.54 
 
 
214 aa  59.7  3e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  25.21 
 
 
233 aa  60.1  3e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1922  outer membrane protein W  28.38 
 
 
212 aa  60.1  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0854242  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1864  outer membrane protein W  28.38 
 
 
212 aa  60.1  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  26.74 
 
 
214 aa  59.3  4e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  27.22 
 
 
214 aa  59.3  4e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  25.95 
 
 
213 aa  59.3  5e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  26.06 
 
 
214 aa  58.9  6e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  31.7 
 
 
215 aa  58.5  8e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  25.44 
 
 
245 aa  57.4  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  28.06 
 
 
243 aa  57.8  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  28.07 
 
 
219 aa  57.8  1e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  3.5393e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  27.71 
 
 
202 aa  57  2e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  28.39 
 
 
227 aa  56.6  3e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  26.28 
 
 
243 aa  55.5  6e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3286  OmpW family protein  28.74 
 
 
224 aa  55.5  7e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  27.91 
 
 
201 aa  55.1  9e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  27.91 
 
 
203 aa  55.1  9e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  27.04 
 
 
229 aa  54.7  1e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  27.56 
 
 
227 aa  54.7  1e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  24.23 
 
 
217 aa  54.7  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  26.92 
 
 
230 aa  53.9  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0979  OmpW family protein  29.47 
 
 
223 aa  54.3  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  26.51 
 
 
229 aa  53.9  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  27.23 
 
 
228 aa  53.1  3e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  28.75 
 
 
224 aa  53.1  3e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  28.93 
 
 
204 aa  53.1  3e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  28.57 
 
 
218 aa  52.8  4e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  26.48 
 
 
195 aa  52.8  4e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  26.48 
 
 
195 aa  52.8  4e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  25.36 
 
 
209 aa  52  8e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.28049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  25.1 
 
 
224 aa  51.6  9e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  31.21 
 
 
222 aa  51.6  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  25.14 
 
 
224 aa  50.8  1e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  30.26 
 
 
211 aa  51.2  1e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  28.67 
 
 
209 aa  51.2  1e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  30.9 
 
 
233 aa  50.8  1e-05  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  24.49 
 
 
239 aa  50.4  2e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  29.22 
 
 
198 aa  50.4  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  28.21 
 
 
229 aa  50.4  2e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  25.16 
 
 
264 aa  50.1  2e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  27.42 
 
 
198 aa  50.1  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  27 
 
 
216 aa  50.8  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  23.98 
 
 
239 aa  50.1  3e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2579  OmpW  26.22 
 
 
228 aa  50.1  3e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.793769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  27.27 
 
 
224 aa  49.7  4e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>