More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1965 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  74.9 
 
 		 814 aa  1165    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  99.12 
 
 		 792 aa  1601    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  72.04 
 
 		 813 aa  1131    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 792 aa  1613    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  41.51 
 
 		 772 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  41.4 
 
 		 775 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  42.99 
 
 		 748 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  41.14 
 
 		 774 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  40.08 
 
 		 773 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  39.79 
 
 		 773 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  39.92 
 
 		 773 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  39.61 
 
 		 773 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  40 
 
 		 774 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  38.91 
 
 		 773 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  39.82 
 
 		 778 aa  509  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  38.65 
 
 		 773 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  39.71 
 
 		 772 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  39.92 
 
 		 780 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  38.24 
 
 		 777 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  39.13 
 
 		 780 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  41.26 
 
 		 776 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  38.3 
 
 		 759 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  36.48 
 
 		 827 aa  475  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  38.03 
 
 		 830 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  35.96 
 
 		 827 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  38.84 
 
 		 881 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  36.36 
 
 		 768 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  35.97 
 
 		 781 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  36.64 
 
 		 766 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  40.53 
 
 		 732 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  35.9 
 
 		 742 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  36.35 
 
 		 768 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  36.29 
 
 		 764 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  36.83 
 
 		 779 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  35.89 
 
 		 764 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  35.89 
 
 		 764 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  37.25 
 
 		 790 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 787 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  37.24 
 
 		 774 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  37.24 
 
 		 774 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  37.24 
 
 		 774 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  36.96 
 
 		 791 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  36.75 
 
 		 789 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  36.57 
 
 		 779 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  36.06 
 
 		 790 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  34.2 
 
 		 796 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  36.05 
 
 		 777 aa  430  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  34.33 
 
 		 790 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  35.65 
 
 		 791 aa  432  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  35.53 
 
 		 833 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  34.85 
 
 		 826 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  34.85 
 
 		 826 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  34.85 
 
 		 824 aa  419  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  34.47 
 
 		 754 aa  419  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  36.13 
 
 		 769 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  36.04 
 
 		 827 aa  415  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  36.07 
 
 		 840 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  36.07 
 
 		 840 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  35.01 
 
 		 826 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  36.07 
 
 		 840 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  36.47 
 
 		 836 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  36.07 
 
 		 840 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  35.29 
 
 		 826 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  35.9 
 
 		 766 aa  399  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  35.93 
 
 		 840 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  35.5 
 
 		 841 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  35.5 
 
 		 841 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  35.5 
 
 		 844 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  34.78 
 
 		 841 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  35.5 
 
 		 844 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  35.5 
 
 		 844 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  35.5 
 
 		 844 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  35.5 
 
 		 844 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  35.64 
 
 		 840 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  35.5 
 
 		 844 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  33.91 
 
 		 730 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.45 
 
 		 757 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 		 766 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  29.64 
 
 		 890 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.52 
 
 		 646 aa  268  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.67 
 
 		 739 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.56 
 
 		 734 aa  258  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.83 
 
 		 707 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  34.92 
 
 		 735 aa  255  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.52 
 
 		 727 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  35.35 
 
 		 720 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.12 
 
 		 709 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  34.54 
 
 		 705 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  35.58 
 
 		 709 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  35.58 
 
 		 709 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  35.21 
 
 		 714 aa  250  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.29 
 
 		 642 aa  249  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  30.04 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  36.01 
 
 		 757 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  34.26 
 
 		 734 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  36.86 
 
 		 714 aa  246  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  35.52 
 
 		 714 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 720 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  30.75 
 
 		 701 aa  245  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  31.05 
 
 		 744 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>