131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1930 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  789    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  98.18 
 
 
384 aa  776    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  61.33 
 
 
366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  58.91 
 
 
377 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  30.63 
 
 
352 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  32.42 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  31.12 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  32.26 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  31.99 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  31.3 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  30.03 
 
 
341 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  32.98 
 
 
401 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  30.42 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  30.91 
 
 
341 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  30.83 
 
 
341 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  30.94 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.22 
 
 
393 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  29.3 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  30.25 
 
 
387 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  28.61 
 
 
369 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  28.89 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  30.85 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.53 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  28.03 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  27.34 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  29.33 
 
 
419 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  27.84 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.32 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 
376 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 
376 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  27.42 
 
 
367 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  29.6 
 
 
426 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 
376 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  31.39 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  31.03 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  31.15 
 
 
420 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  27.48 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  30.54 
 
 
346 aa  135  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  29.73 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  29 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  27.18 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  30.75 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  27.79 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  26.93 
 
 
374 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 
405 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  28.69 
 
 
369 aa  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  30.67 
 
 
341 aa  132  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  28.76 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  26.68 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  27.39 
 
 
345 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  30.45 
 
 
408 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  28.84 
 
 
395 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  27.76 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  29.11 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  27.62 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  26.87 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  28.24 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  26.87 
 
 
377 aa  122  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  24.93 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  30.28 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  28.25 
 
 
358 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  24.68 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  23.61 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  25.56 
 
 
364 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  24.56 
 
 
364 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  25.34 
 
 
391 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  25.28 
 
 
349 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  25.28 
 
 
349 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  26.39 
 
 
359 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  26.67 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  52.24 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  23.61 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  40.78 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  24.69 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  44.3 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  24.38 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  24.38 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  45.07 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  44.59 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  22.83 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  27.96 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  52 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  49.12 
 
 
394 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  43.14 
 
 
377 aa  54.7  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  37.68 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  48.21 
 
 
219 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  38.33 
 
 
235 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  43.4 
 
 
167 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  35.48 
 
 
651 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  36.67 
 
 
148 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  37.14 
 
 
203 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  37.68 
 
 
243 aa  46.6  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  40.38 
 
 
161 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  44.9 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  36.67 
 
 
166 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  42.55 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
307 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  40 
 
 
205 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  31.67 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>