More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1870 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  77.02 
 
 
398 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  82.21 
 
 
402 aa  701    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  98.75 
 
 
399 aa  803    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  82.71 
 
 
402 aa  704    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  100 
 
 
400 aa  818    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  52.88 
 
 
399 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  49.24 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  40.41 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  37.44 
 
 
421 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  38.07 
 
 
401 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  37.47 
 
 
402 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.47 
 
 
399 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  35.09 
 
 
414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.74 
 
 
423 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.41 
 
 
405 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.04 
 
 
411 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  35.52 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.18 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.01 
 
 
405 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.18 
 
 
426 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.17 
 
 
410 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.67 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  37.81 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.34 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.75 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  35.08 
 
 
415 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.36 
 
 
417 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  33.17 
 
 
413 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.95 
 
 
405 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.43 
 
 
427 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.6 
 
 
406 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.41 
 
 
417 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.41 
 
 
420 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.69 
 
 
400 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.74 
 
 
411 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.58 
 
 
406 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33 
 
 
411 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.5 
 
 
412 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.39 
 
 
429 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.67 
 
 
407 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  35.29 
 
 
404 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  33 
 
 
422 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.49 
 
 
411 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  33.5 
 
 
429 aa  202  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  33.42 
 
 
408 aa  202  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.02 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.08 
 
 
411 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.08 
 
 
411 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.55 
 
 
402 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  32.91 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  31.27 
 
 
414 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  35.5 
 
 
387 aa  199  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.92 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.84 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.42 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.16 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  36.34 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.42 
 
 
411 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.44 
 
 
407 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  33.42 
 
 
419 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  33.6 
 
 
417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  31.38 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  34.86 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.73 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.38 
 
 
412 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  33.51 
 
 
410 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.46 
 
 
412 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.05 
 
 
436 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.99 
 
 
388 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  35.07 
 
 
421 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  32.7 
 
 
398 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.44 
 
 
405 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.42 
 
 
411 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  35.01 
 
 
417 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  32.32 
 
 
411 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  32.23 
 
 
442 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.89 
 
 
402 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  33.95 
 
 
405 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.15 
 
 
407 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  32.47 
 
 
406 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.5 
 
 
422 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.76 
 
 
408 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.71 
 
 
417 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  31.54 
 
 
413 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  33.6 
 
 
409 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  31.1 
 
 
408 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.54 
 
 
409 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  32.59 
 
 
414 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  33.33 
 
 
415 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  36.33 
 
 
408 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  29.95 
 
 
404 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.05 
 
 
394 aa  186  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  32.7 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.5 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  34.3 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  34.7 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.81 
 
 
418 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>