More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1679 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  100 
 
 		 410 aa  844    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  33.33 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  31.19 
 
 		 417 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  31.33 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  32.98 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  28.94 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  29.23 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  31.27 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.63 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  27.56 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  29.32 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  27.94 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.82 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  27.92 
 
 		 452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  26.42 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  27.32 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  25.96 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.12 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30.79 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  29.07 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  26.13 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.05 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  28.71 
 
 		 417 aa  96.3  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  26.82 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.04 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  28.76 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.17 
 
 		 463 aa  92.8  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  27.81 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  26.25 
 
 		 448 aa  90.5  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.32 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  28.17 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.01 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  27.36 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.01 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  26.32 
 
 		 487 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  25.17 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  26.39 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.39 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  26.39 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.59 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.54 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  27.02 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  25.85 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  26.42 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  29.39 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  29.39 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.15 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  23.76 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  25.78 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  25.33 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  24.24 
 
 		 398 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.44 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  24.88 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.35 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  25.13 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  45.98 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  26.1 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  23.86 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.03 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.78 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  29.84 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.63 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  25.19 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  23.53 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  26.25 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  25.71 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  26.03 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  25 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  24.37 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.06 
 
 		 403 aa  67  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.64 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.5 
 
 		 433 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.95 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.91 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.08 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  22.78 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  26.51 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  24.62 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.03 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>