More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1659 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  98.56 
 
 
209 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  75.34 
 
 
179 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  72.59 
 
 
133 aa  205  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  54.6 
 
 
173 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  60.32 
 
 
181 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  60.32 
 
 
181 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  50.31 
 
 
177 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  49.08 
 
 
178 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  53.15 
 
 
177 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  58.4 
 
 
177 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  55.17 
 
 
177 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  58.4 
 
 
197 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  53.79 
 
 
177 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  53.15 
 
 
174 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  49.34 
 
 
160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  48.68 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  56.2 
 
 
226 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  47.93 
 
 
364 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  47.02 
 
 
353 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  52.34 
 
 
188 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  46.43 
 
 
354 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
369 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  45.24 
 
 
248 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  52.42 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  45.83 
 
 
363 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  53.72 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  45.24 
 
 
363 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  45.24 
 
 
363 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  41.77 
 
 
234 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  41.77 
 
 
234 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  45.18 
 
 
382 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  42.41 
 
 
234 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  41.77 
 
 
234 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  41.77 
 
 
218 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  52.42 
 
 
198 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  41.77 
 
 
218 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  41.77 
 
 
218 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  41.77 
 
 
218 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  52 
 
 
226 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  42.77 
 
 
258 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  49.26 
 
 
225 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  47.34 
 
 
173 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  50 
 
 
224 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  44.08 
 
 
223 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  49.21 
 
 
208 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  44.08 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  44.08 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  53.72 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  45.14 
 
 
407 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  51.64 
 
 
249 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  52.07 
 
 
404 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  45.14 
 
 
407 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  48.82 
 
 
208 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  48.82 
 
 
208 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  43.42 
 
 
223 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  45.14 
 
 
407 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  45.14 
 
 
407 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  45.14 
 
 
404 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  45.14 
 
 
407 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  45.14 
 
 
404 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  43.42 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  43.59 
 
 
207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  48.48 
 
 
205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  46.31 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  52.07 
 
 
418 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  50.77 
 
 
234 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  47.26 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  49.18 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  43.6 
 
 
407 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  49.18 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  49.18 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  50.41 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  47.97 
 
 
169 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  45.64 
 
 
215 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  48.36 
 
 
223 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0020  NLP/P60 protein  48.92 
 
 
184 aa  131  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  47.73 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  50 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  42.57 
 
 
222 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  51.24 
 
 
287 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  39.29 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  51.24 
 
 
279 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  42.52 
 
 
283 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  49.6 
 
 
210 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  41.73 
 
 
283 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  45.19 
 
 
205 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  43.51 
 
 
170 aa  121  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
283 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  40.94 
 
 
283 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  38.73 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  40.94 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
283 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  44.44 
 
 
193 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3747  NLP/P60  44.37 
 
 
166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60725  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  40.62 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  41.22 
 
 
275 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
220 aa  118  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
271 aa  118  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>