135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1510 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  762    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  98.66 
 
 
373 aa  752    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  69.35 
 
 
375 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  66.12 
 
 
374 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
276 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  32.31 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
274 aa  116  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  32 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 
283 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
505 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  28.46 
 
 
437 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  26.72 
 
 
439 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  27.88 
 
 
443 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  27.14 
 
 
443 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.6 
 
 
375 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 
274 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  24.08 
 
 
447 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.92 
 
 
379 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  27.55 
 
 
439 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 
379 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.7 
 
 
377 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  28.68 
 
 
375 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  32.46 
 
 
242 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.3 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.65 
 
 
384 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.06 
 
 
384 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.7 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.07 
 
 
383 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.01 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
379 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.01 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.01 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.01 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 
383 aa  86.7  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  30.62 
 
 
279 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.81 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  26.28 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.2 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.88 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.83 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.94 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.83 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.37 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.37 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.18 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  26.87 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  30.53 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  26.98 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  27.53 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  26.49 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  27.35 
 
 
266 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 
245 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  26.42 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  23.35 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  23.35 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  28.12 
 
 
706 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 
243 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  24.01 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  29.48 
 
 
253 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  25.77 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  24.7 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  27.83 
 
 
286 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.18 
 
 
742 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  28.89 
 
 
250 aa  53.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  25.79 
 
 
258 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  25.51 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  23.86 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  25.68 
 
 
293 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  24.02 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  21.54 
 
 
369 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
295 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  23.64 
 
 
288 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  30.39 
 
 
237 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
371 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>