180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1502 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  100 
 
 		 513 aa  1055    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  97.08 
 
 		 511 aa  999    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  62.29 
 
 		 533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  55.7 
 
 		 508 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  37.19 
 
 		 502 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  34.28 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  30.79 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  31.79 
 
 		 535 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  31.79 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  31.79 
 
 		 539 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  32.81 
 
 		 519 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  32.45 
 
 		 527 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  31.57 
 
 		 539 aa  223  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  30.79 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  32.03 
 
 		 521 aa  217  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  30.57 
 
 		 545 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  31.74 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  30.37 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  30.35 
 
 		 538 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  31.39 
 
 		 517 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  31.4 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  31.49 
 
 		 480 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.7 
 
 		 688 aa  150  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  28.12 
 
 		 669 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  27.58 
 
 		 693 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  28.22 
 
 		 670 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 675 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 503 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 680 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  27.18 
 
 		 485 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  26.06 
 
 		 475 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  26.22 
 
 		 507 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  26.2 
 
 		 668 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 645 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.37 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  25.77 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  26.64 
 
 		 495 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  25.25 
 
 		 656 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  25.72 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  25.72 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  27.42 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  25.72 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  26.89 
 
 		 506 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.74 
 
 		 740 aa  90.5  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  26 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  24.6 
 
 		 522 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  22.55 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  24.28 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  27.63 
 
 		 485 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  25.6 
 
 		 524 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.65 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  27.61 
 
 		 521 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  28.63 
 
 		 300 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  25.12 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  27.25 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  24.48 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  24.82 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  25.61 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  26.21 
 
 		 521 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  25.38 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  24.88 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  26.61 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  26.45 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  29 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  24.56 
 
 		 546 aa  77.4  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  32.97 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  27.9 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  27.46 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  24.63 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  25.21 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  25.57 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  31.72 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.08 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  25.46 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  27.01 
 
 		 571 aa  72  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  28.34 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  28.34 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  27.03 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  28.34 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  27.43 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  26.91 
 
 		 538 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  27.51 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  27.91 
 
 		 508 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  23.62 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1897  TAP domain protein  26.39 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  25.32 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  24.25 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  31.4 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  25.06 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  23.09 
 
 		 625 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0548452  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  21.14 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  24.01 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  30.17 
 
 		 597 aa  66.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  24.03 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1577  TAP domain protein  25 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  28.06 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>