More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1501 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  99.19 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  78.23 
 
 		 248 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  74.19 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  56.45 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  54.84 
 
 		 244 aa  285  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  56.49 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  56.05 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  57.43 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  55.24 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  55.24 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  55.24 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  54.84 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  54.84 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  54.84 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  54.44 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  55.42 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  54.44 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  51 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  51.95 
 
 		 262 aa  255  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  44.86 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  44.44 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  46.69 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  44.21 
 
 		 260 aa  215  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 273 aa  214  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  47.74 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  39.84 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  40.32 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  44.3 
 
 		 340 aa  187  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  39.58 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  43.53 
 
 		 337 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  41.67 
 
 		 295 aa  182  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  39 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  39.52 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  41.18 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  40.34 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  40.43 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  36.84 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  40.97 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  42.37 
 
 		 332 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 241 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.48 
 
 		 316 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  36.59 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  42.29 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  39.46 
 
 		 338 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.1 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.73 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  38.96 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.73 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 		 356 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  40.81 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  40.09 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.79 
 
 		 309 aa  168  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.74 
 
 		 334 aa  168  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  39.42 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  41.63 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.56 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.08 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  40.16 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  37.29 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 279 aa  165  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  33.91 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  40.49 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 		 411 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  36.13 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  42.51 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.46 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  36.63 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 315 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  35.34 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  38.03 
 
 		 334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  40.36 
 
 		 337 aa  162  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.18 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  36.57 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  33.47 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.81 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>