109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1475 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  654    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  98.11 
 
 		 317 aa  642    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  59.25 
 
 		 303 aa  349  5e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  57.52 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  58.27 
 
 		 295 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  57.52 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  58.49 
 
 		 292 aa  325  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 404 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 404 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 404 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 404 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 395 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 395 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 486 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  57.04 
 
 		 444 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  54.51 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  53.76 
 
 		 295 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  58.89 
 
 		 299 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  53.38 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  53.38 
 
 		 295 aa  315  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  53.38 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  52.79 
 
 		 291 aa  305  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  52.45 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  52.83 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  52.29 
 
 		 293 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  52.29 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  52.47 
 
 		 291 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  46.49 
 
 		 287 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  45.19 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.57 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  45.19 
 
 		 299 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  41.77 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  44.81 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  46.89 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  44.36 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  44.36 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  44.36 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  44.36 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  43.61 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  44.81 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  40.75 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.11 
 
 		 289 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  40.23 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  38.72 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  43.35 
 
 		 293 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.27 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.83 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  35.25 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  34.87 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  37.96 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  39.78 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  32.37 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  23.93 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  27.64 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 526 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  21.37 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.53 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  22.18 
 
 		 591 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  20.51 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  24.23 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25.87 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  23.73 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0354  Beta-lactamase  26.67 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5080  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.78 
 
 		 832 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.411729  normal  0.0251813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 441 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  22.75 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  24.7 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.14 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 325 aa  45.8  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  24.66 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3261  Beta-lactamase  23.6 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611903  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  23.01 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  22.48 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 597 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  23.15 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  23.44 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.94 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2593  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.3 
 
 		 767 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>