More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1344 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  47.66 
 
 
793 aa  716  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  45.81 
 
 
800 aa  640  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  54.55 
 
 
784 aa  800  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  50.96 
 
 
795 aa  738  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  100 
 
 
788 aa  1615  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  1.20084e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  69.64 
 
 
795 aa  1139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  99.62 
 
 
788 aa  1612  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  4.56142e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  48.08 
 
 
793 aa  719  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  45.47 
 
 
800 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  5.69019e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  46.51 
 
 
799 aa  625  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  41.1 
 
 
843 aa  544  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  40.54 
 
 
853 aa  539  1e-152  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  40.54 
 
 
803 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  38.39 
 
 
811 aa  493  1e-138  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 
812 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 
812 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.60682e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  37.97 
 
 
817 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 
812 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 
803 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 
797 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 
797 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.40414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 
797 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.61093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  38.43 
 
 
795 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 
797 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.41597e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  37.47 
 
 
811 aa  468  1e-130  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  37.01 
 
 
797 aa  459  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 
933 aa  448  1e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 
835 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  36.79 
 
 
815 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  36.78 
 
 
821 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 
815 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 
847 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 
853 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  35.53 
 
 
817 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 
811 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 
800 aa  417  1e-115  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  35.6 
 
 
840 aa  417  1e-115  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  37.33 
 
 
883 aa  407  1e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 
948 aa  409  1e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 
924 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 
818 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 
871 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  35.1 
 
 
848 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  33.72 
 
 
870 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  1.76254e-05  unclonable  3.3388e-08 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  36.2 
 
 
884 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 
918 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  33.7 
 
 
961 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  34.34 
 
 
823 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 
842 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 
804 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  33.74 
 
 
885 aa  375  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 
847 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  33.46 
 
 
874 aa  368  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 
868 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.37 
 
 
832 aa  359  1e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.47 
 
 
1015 aa  355  3e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 
858 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 
861 aa  353  9e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.34 
 
 
856 aa  351  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.49 
 
 
867 aa  351  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  7.92676e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 
851 aa  351  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 
872 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  31 
 
 
864 aa  347  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 
887 aa  347  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 
842 aa  345  3e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 
987 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 
850 aa  339  1e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 
813 aa  338  2e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 
924 aa  337  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 
816 aa  334  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 
833 aa  327  4e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 
947 aa  325  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 
877 aa  320  8e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.78647e-05  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 
852 aa  303  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 
873 aa  301  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 
858 aa  294  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 
849 aa  292  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  32.97 
 
 
948 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 
879 aa  260  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 
867 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 
867 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
857 aa  210  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 
870 aa  191  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  6.3349e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 
869 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
855 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
855 aa  144  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.10647e-05  hitchhiker  9.76809e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  41.09 
 
 
953 aa  123  1e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 
935 aa  116  2e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  4.43965e-05  decreased coverage  3.74921e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 
935 aa  116  2e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  6.85263e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  39.8 
 
 
935 aa  116  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 
871 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 
930 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 
930 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 
930 aa  114  1e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  5.15529e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  36.12 
 
 
869 aa  112  4e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  37.69 
 
 
936 aa  111  4e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  36.22 
 
 
904 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  37.88 
 
 
937 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.22883e-05  hitchhiker  2.0018e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 
904 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 
904 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>