More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1265 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  88.35 
 
 		 331 aa  528  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  86.41 
 
 		 309 aa  517  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 349 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 354 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 340 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 349 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  34.89 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  29.28 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.22 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.46 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  31.86 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  32.85 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  29.1 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  29.77 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  28.29 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  30.28 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 348 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.2 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  28.52 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 335 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.84 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  29.55 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  27.74 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.15 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  24.33 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  28.91 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  32.96 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.96 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  39.6 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  43.16 
 
 		 114 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  39.02 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 114 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 117 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  27.4 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2320  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.31 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.03 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.79 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  43.27 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  36.79 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  27.54 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.9 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 		 118 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>