176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1185 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  91.15 
 
 		 339 aa  645    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  90.27 
 
 		 339 aa  640    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  89.68 
 
 		 339 aa  634    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  100 
 
 		 339 aa  697    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  89.68 
 
 		 339 aa  638    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  88.2 
 
 		 339 aa  625  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  87.32 
 
 		 339 aa  618  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  87.61 
 
 		 339 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  86.43 
 
 		 339 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  55.81 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  55.81 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  58.79 
 
 		 182 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  41.3 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  38.55 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2649  phage integrase family protein  52.23 
 
 		 160 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01846  hypothetical protein  65.98 
 
 		 153 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  39.32 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  36.27 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  30.72 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  34.85 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  31.44 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  31.67 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  28.12 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  27.33 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  28.27 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  29.06 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  29.06 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  27.76 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  29.39 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  29.39 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.43 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  31.96 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  26.29 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.37 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.84 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  25.55 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  26.91 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  28.24 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.02 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  28.42 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  26.8 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  27.31 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.77 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 451 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  26.35 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  29.27 
 
 		 387 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.05 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.07 
 
 		 456 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  31.97 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  32.2 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 228 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  26.07 
 
 		 451 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 451 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.94 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  23.42 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  30 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  26 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  30 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  31.18 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  26.43 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.33 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  30.77 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  30.77 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.94 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  31.18 
 
 		 284 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  25.3 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  28.47 
 
 		 228 aa  49.7  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  25 
 
 		 425 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.59 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  25.95 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.8 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  23.46 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.03 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  25 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  26.56 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  26.45 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  29.87 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.36 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.36 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>