51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1143 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  100 
 
 
93 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  100 
 
 
93 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  98.92 
 
 
93 aa  193  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  68.82 
 
 
101 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  64.52 
 
 
92 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  61.29 
 
 
92 aa  124  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  56.99 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  56.99 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  59.14 
 
 
92 aa  114  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  58.06 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  55.91 
 
 
92 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  54.84 
 
 
108 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  50.54 
 
 
92 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  50.54 
 
 
114 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  44.09 
 
 
92 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  46.32 
 
 
94 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  47.31 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
92 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  42.39 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  35.48 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  38.04 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  38.04 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  38.95 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42010  hypothetical protein  44.29 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  35.79 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  34.74 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  45.16 
 
 
61 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 
92 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  37.23 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  37.76 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  36.17 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  29.17 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  55.26 
 
 
51 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1586  killer protein, putative  31.58 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  31.25 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>