62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1078 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  44.06 
 
 
718 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  44.55 
 
 
718 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  44.97 
 
 
718 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  44.81 
 
 
718 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  44.48 
 
 
718 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  44.55 
 
 
718 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  44.41 
 
 
718 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  45.43 
 
 
718 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  44.48 
 
 
718 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  44.78 
 
 
738 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  45.39 
 
 
718 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  44.06 
 
 
718 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  67.41 
 
 
720 aa  1025    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  100 
 
 
716 aa  1487    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  44.32 
 
 
718 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  69.55 
 
 
707 aa  1057    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  93.44 
 
 
716 aa  1372    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  44.06 
 
 
718 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  44.12 
 
 
718 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  43.54 
 
 
718 aa  631  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  44.19 
 
 
731 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  44.7 
 
 
721 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  43.32 
 
 
734 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  43.4 
 
 
731 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  42.8 
 
 
743 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  42.38 
 
 
739 aa  602  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  42.74 
 
 
732 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  43.19 
 
 
732 aa  598  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  42.84 
 
 
740 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  42.34 
 
 
732 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  42.47 
 
 
732 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  42.92 
 
 
732 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  42.4 
 
 
732 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  42.4 
 
 
732 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  42.34 
 
 
732 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  41.81 
 
 
732 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  41.73 
 
 
729 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  41.9 
 
 
941 aa  571  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  43.89 
 
 
715 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  40.62 
 
 
732 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  39.2 
 
 
767 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  34.46 
 
 
786 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  31.88 
 
 
725 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  31.63 
 
 
704 aa  351  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  32.38 
 
 
722 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  31.55 
 
 
718 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  31.75 
 
 
720 aa  324  3e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  31.41 
 
 
712 aa  324  4e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  29.61 
 
 
714 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  29.47 
 
 
714 aa  301  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  28.49 
 
 
721 aa  288  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  28.92 
 
 
713 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  29.45 
 
 
706 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  29.17 
 
 
706 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  28.69 
 
 
688 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  29.39 
 
 
706 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  28.32 
 
 
701 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  29.86 
 
 
714 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  26.49 
 
 
710 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  27.76 
 
 
751 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  28.14 
 
 
711 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  26.74 
 
 
759 aa  162  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>