292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1074 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  65.69 
 
 
502 aa  635  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  67.25 
 
 
499 aa  673  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  98.43 
 
 
510 aa  993  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  100 
 
 
510 aa  1009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  39.61 
 
 
501 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  38.2 
 
 
489 aa  306  4e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  6.07679e-08  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  38.2 
 
 
489 aa  307  4e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.02128e-07  hitchhiker  7.91426e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  38.2 
 
 
489 aa  306  4e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  37.33 
 
 
490 aa  303  4e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.1541e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  37 
 
 
490 aa  302  7e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.91592e-07  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  38.12 
 
 
489 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.17071e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  37.13 
 
 
501 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.44318e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  37.33 
 
 
491 aa  296  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  37.13 
 
 
501 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.64206e-06  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  37.13 
 
 
501 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  36.21 
 
 
499 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  4.22142e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  36.27 
 
 
501 aa  293  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  36.51 
 
 
527 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  35.63 
 
 
500 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.47826e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  37.98 
 
 
489 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.48 
 
 
544 aa  281  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  37.23 
 
 
462 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  36.58 
 
 
496 aa  280  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  37.25 
 
 
462 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  36.9 
 
 
451 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  37.23 
 
 
498 aa  275  1e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  37.27 
 
 
444 aa  275  2e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.33 
 
 
516 aa  272  9e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  33.94 
 
 
544 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.81 
 
 
517 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  34.58 
 
 
494 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  36.2 
 
 
507 aa  264  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  36.01 
 
 
517 aa  264  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  35.33 
 
 
479 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  35.46 
 
 
497 aa  263  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  36.71 
 
 
504 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  34.31 
 
 
516 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  33.69 
 
 
495 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  36.67 
 
 
497 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  36.84 
 
 
461 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  36.84 
 
 
461 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.84184e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  36.62 
 
 
461 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  36.47 
 
 
497 aa  259  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  36.48 
 
 
463 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  38.72 
 
 
461 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.67379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  38.5 
 
 
461 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.69558e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  38.5 
 
 
461 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  8.22499e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  38.5 
 
 
461 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.79304e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  38.5 
 
 
461 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.9773e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  38.5 
 
 
461 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.79263e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  38.5 
 
 
461 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87987e-11 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  38.5 
 
 
461 aa  255  1e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.40471e-06  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  36.67 
 
 
498 aa  254  2e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  38.05 
 
 
461 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.79332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  31.95 
 
 
603 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  37.83 
 
 
461 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.92962e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.93 
 
 
446 aa  250  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.93 
 
 
446 aa  250  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  34.67 
 
 
501 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  37.66 
 
 
464 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  36.18 
 
 
452 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.52854e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  36.18 
 
 
452 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  34.65 
 
 
497 aa  246  7e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  35.17 
 
 
512 aa  245  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  35.17 
 
 
512 aa  245  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  34.8 
 
 
495 aa  245  2e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.00169e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  33.52 
 
 
495 aa  241  3e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  35.44 
 
 
516 aa  240  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  35.18 
 
 
517 aa  240  6e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  38.17 
 
 
477 aa  240  6e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  3.22625e-05  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  33.93 
 
 
467 aa  237  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  37.36 
 
 
449 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.21919e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  37.36 
 
 
449 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.99815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  31.78 
 
 
539 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  32.16 
 
 
539 aa  235  1e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  31.28 
 
 
539 aa  236  1e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  31.6 
 
 
539 aa  235  2e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  36.91 
 
 
449 aa  234  2e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.38038e-07  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  34.99 
 
 
483 aa  235  2e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  31.97 
 
 
490 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  35.93 
 
 
524 aa  232  9e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.64 
 
 
534 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 
489 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  33.62 
 
 
509 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  36.69 
 
 
449 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  34.59 
 
 
482 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  31.69 
 
 
489 aa  226  5e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  31.69 
 
 
489 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  31.69 
 
 
489 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  31.69 
 
 
489 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  31.69 
 
 
489 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  31.69 
 
 
489 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  31.69 
 
 
489 aa  226  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  31.69 
 
 
489 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  37.56 
 
 
395 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.14111e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  31.69 
 
 
489 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  34.53 
 
 
520 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  29.3 
 
 
584 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  33.6 
 
 
501 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.26 
 
 
483 aa  223  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>